både tillväxt och immunförmåga är viktiga egenskaper vid djuruppfödning. Databasen animal quantitative trait loci (QTL) är en värdefull resurs och kan användas för att tolka de genetiska mekanismer som ligger till grund för tillväxt och immunegenskaper. QTL-intervaller involverar emellertid ofta för många kandidatgener för att hitta de sanna kausala generna. Därför var syftet med denna studie att tillhandahålla en effektiv annoteringsrörledning som kan utnyttja informationen om Gen Ontologitermer annotering, länkgenblock och vägar för att ytterligare identifiera pleiotropa gener och genuppsättningar i överlappande intervaller av tillväxtrelaterade och immunitetsrelaterade QTLs. Totalt identifierades 55 icke-redundanta QTL-överlappande intervall, 1893 tillväxtrelaterade gener och 713 immunitetsrelaterade gener klassificerades ytterligare i överlappande intervall och 405 pleiotropa gener delade av de två genuppsättningarna bestämdes. Dessutom upptäcktes 19 pleiotropa genbindningsblock och 67 vägar relaterade till immunitet och tillväxtegenskaper. Totalt 343 tillväxtrelaterade gener och 144 immunitetsrelaterade gener involverade i pleiotropa vägar identifierades också. Vi sekvenserade och genotypade också 284 individer från kinesiska Meishan-grisar och europeiska grisar och kartlade de enskilda nukleotidpolymorfismerna (SNP) till de pleiotropa generna och genuppsättningarna som vi identifierade. Totalt 971 SNP: er med hög förtroende kartlades till de pleiotropa generna och genuppsättningarna som vi identifierade, och bland dem var 743 SNP: er statistiskt signifikanta i allelfrekvens mellan Meishan och Europeiska grisar. Denna studie undersöker förhållandet mellan tillväxt och immunitetsegenskaper från synen på QTL överlappande intervaller och kan generaliseras för att utforska relationerna mellan andra egenskaper.