Oninkriget (1467-1477), som orsakades av en arvstvist inom Ashikaga Shogunate, såg en distinkt uppdelning av centralt kommando och ett uppror mellan ett antal daimyo-klaner som kämpade för dominans. Detta ledde till Sengoku, eller stridande stater period.

många Sengoku-daimyo var tidigare Shugo-daimyo, som steg från provinsens tjänstemän, suppleanter eller från det lokala landet som innehar samurai. Över 150 års krig fortsatte mellan daimyo-krigsherrarna fram till uppkomsten av Oda Nobunaga och hans planer för enande, avslutade av hans skickliga general Toyotomi Hideyoshi, som utnyttjade Oda-makten vid Nobunagas död, och slutligen av Tokugawa Ieyasu. Krigsherrarna delades upp i två stora härar efter Toyotomi Hideyoshis död 1598, med de som stödde den härskande Toyotomi-klanen i de västra styrkorna, och de som stödde den mäktiga Daimyo, Tokugawa Ieyasu i de östra styrkorna. Den mest avgörande striden utkämpades i oktober 1600 vid Sekigahara, och som victor antog Tokugawa Ieyasu rollen som Shogun.

det fanns tre typer av daimyo under Edo-perioden, Tozama, Fudai och Shinpan daimyo. Efter slaget vid Sekigahara 1600 omorganiserade Ieyasu cirka 200 daimyo och deras domäner, baserat på deras förhållande till Tokugawa-klanen.

Tozama, eller ”yttre” daimyo var de som inte var tidigare allierade eller hade anledning att vara oroliga. De erbjöds sällan, om någonsin, statliga positioner. Arrangerade äktenskap mellan familjerna i Tozama daimyo och Tokugawa-klanen, och Sankin Kotai (alternativ närvaro vid domstol) politik höll dem under strikt kontroll.