Obispo Auxiliar de San Franciscoeditar

El 6 de julio de 2010, McElroy fue nombrado obispo auxiliar de San Francisco y Obispo titular de Gemellae en Bizacena por el Papa Benedicto XVI. El 7 de septiembre de 2010, McElroy recibió su consagración episcopal de manos del Arzobispo George Hugh Niederauer de San Francisco, con el Arzobispo emérito John Raphael Quinn de San Francisco y el Obispo John Charles Wester de Salt Lake City sirviendo como consagradores. Como obispo auxiliar, McElroy fue el Vicario Arquidiocesano para la Vida y el Desarrollo de la Parroquia.

Escribiendo en Estados Unidos en 2014, argumentó que el énfasis del Papa Francisco en la desigualdad en la enseñanza social católica

no fue bien con muchos católicos estadounidenses, que criticaron su declaración por ser radical, simplista y confusa. Este rechazo contrasta con la entusiasta recepción que el nuevo Papa ha recibido en los Estados Unidos. Desde el momento de su elección, el Papa Francisco ha captado la atención del pueblo estadounidense con su mensaje y actitud, a la vez que nos ha desafiado a todos a una profunda renovación y reforma en nuestras vidas. Los estadounidenses se animan en el llamado del Papa a construir una cultura eclesiástica que elimine el juzgamiento; aplauden las reformas estructurales en el Vaticano; y admiran el enfoque continuo de Francisco en las necesidades pastorales de los hombres y mujeres comunes.

Obispo de San Diegoeditar

El 3 de marzo de 2015, McElroy fue nombrado sexto Obispo de San Diego por el Papa Francisco, sucediendo al difunto Obispo Cirilo Flores. La diócesis atiende a cerca de un millón de católicos en los condados de San Diego e Imperial. Su instalación tuvo lugar el 15 de abril de 2015 en la Iglesia Católica de Santa Teresa del Carmelo.

McElroy es ampliamente considerado como un partidario de las políticas progresistas del Papa Francisco. Ha escrito con frecuencia y de manera extensa sobre la desigualdad social y la misión de justicia social de la Iglesia. En su primera aparición pública en San Diego, se comprometió a defender la causa de las personas sin hogar, a apoyar una reforma migratoria integral y a prohibir que cualquier persona que haya abusado de menores sirva en el clero u otro empleo en la diócesis.

En una discusión sobre la formación del documento de 2015 «Forming Consciences for Faithful Citizenship» de la Conferencia de Obispos Católicos de los Estados Unidos (USCCB), McElroy argumentó que el documento se centró excesivamente en el aborto y la eutanasia. Dijo que » junto a los temas del aborto y la eutanasia, que son temas centrales en nuestro esfuerzo por transformar este mundo, la pobreza y la degradación de la tierra también son centrales. Pero este documento se ajusta a la estructura de la visión del mundo de 2007. Se inclina a favor del aborto y la eutanasia y excluye la pobreza y el medio ambiente.»Pidió que se desechara por completo. Se informó que sus comentarios habían irritado visiblemente al cardenal Daniel DiNardo, que entonces se desempeñaba como vicepresidente de la USCCB y que más tarde se convirtió en su presidente. En un discurso pronunciado el 17 de febrero de 2016, McElroy llamó a los católicos a «reconocer y enfrentar la fea ola de intolerancia antiislámica» en los Estados Unidos. Denunció como» repetidas falsedades » las afirmaciones de que el Islam es una religión violenta y comparó estas acusaciones con el anticatolicismo del siglo XIX en Estados Unidos.

McElroy es actualmente el vicepresidente de la Conferencia Católica de California y sirve en la USCCB en el comité administrativo, el comité ecuménico, el comité de justicia doméstica y el comité de asuntos internacionales.

En 2017 predicó en el funeral del arzobispo John R. Quinn de San Francisco.

McElroy, al igual que la mayoría de los miembros de la jerarquía de la Iglesia, incluido el Papa Francisco y la Conferencia Episcopal de los Estados Unidos, se ha opuesto a los planes del presidente de los Estados Unidos, Donald Trump, de construir un muro a lo largo de la frontera entre México y los Estados Unidos para limitar la inmigración ilegal. En marzo de 2018, Trump visitó California para ver prototipos para el muro. Después de la visita, McElroy dijo: «Es un día triste para nuestro país cuando cambiamos el simbolismo majestuoso y lleno de esperanza de la Estatua de la Libertad por un muro ineficaz y grotesco, que muestra e inflama las divisiones étnicas y culturales que han sido durante mucho tiempo la parte inferior de nuestra historia nacional.»

En una reunión de 2018, varios laicos católicos le preguntaron a McElroy sobre un hombre abiertamente gay, Aaron Bianco, que trabajaba en la Parroquia San Juan Evangelista. En respuesta a una de sus preguntas, McElroy dijo: «Si la Iglesia eliminara a todos los empleados que no están viviendo las enseñanzas de la Iglesia en su totalidad, estaríamos empleando solo ángeles.»

En 2016, McElroy recibió una carta del psicoterapeuta y experto clerical en abuso sexual Richard Sipe discutiendo la presunta mala conducta sexual del cardenal retirado Theodore McCarrick. En una discusión anterior, McElroy había pedido a Sipes cualquier material que corroborara sus alegaciones.

» Le pregunté si podía compartir esta información conmigo, especialmente porque algunas de sus acusaciones involucraban a personas aún activas en la vida de la Iglesia. El Dr. Sipe dijo que no podía compartir información documental específica que corroborara sus afirmaciones….El Dr. Sipe hizo muchas contribuciones significativas para comprender las dimensiones del abuso sexual del clero en los Estados Unidos y para ayudar a las víctimas. Pero las limitaciones de su disposición a compartir información corroborativa hicieron imposible saber qué era real y qué era un rumor.»

las supuestas acciones de McCarrick se hicieron públicas en junio de 2018 y fue destituido del ministerio público después de que el Vaticano considerara creíble una acusación.

En 2020, 3 semanas antes de las elecciones presidenciales de Estados Unidos, McElroy criticó a aquellos que cuestionaban la fe católica personal de Biden basada en sus posiciones sobre el aborto, denunciándolo como «un asalto al significado de lo que es ser católico.»McElroy dijo que aunque los actos de aborto son intrínsecamente malos, la legislación al respecto es una cuestión de juicio prudencial, y además que la identidad católica no se sostiene ni cae en una sola posición política. La enseñanza social y la identidad católicas abarcan cosas como la solidaridad, la compasión, el amor por la iglesia y «tener una relación llena de gracia con Dios».