The Moody Blues a cântat live la concertul de caritate Birmingham Heart Beat din 1986, care a strâns bani pentru Spitalul de copii din Birmingham. Trupa a cântat patru melodii, iar mai târziu a oferit backup cu Electric Light Orchestra pentru George Harrison.the Moodies și-au continuat succesul de la începutul generației video cu Sur La Mer (1988) și videoclipul și single-ul său, „I Know You’ re Out there Somewhere” (No.30 US, No. 52 UK, No. 2 US Mainstream Rock), o continuare a „YOUR Wildest Dreams”. Sunetul lor a căpătat o calitate din ce în ce mai sintetică și tehnică, pe măsură ce Moraz și Visconti au început să folosească secvențiatoare moderne, samplere și mașini cu tambur. În acest timp, Justin Hayward și John Lodge au scris și cântat pe majoritatea pieselor, deoarece trupa a fost supusă presiunii noii lor case de discuri, Polygram Records, pentru a-i promova pe cei considerați a fi cei doi membri cu aspect comercial și sonor. Ray Thomas juca un rol diminuat în studio. Trupa evolua într-un act synthpop, cu muzică deloc potrivită pentru un flaut (deși Ray Thomas a oferit de fapt percuție suplimentară, în special o tamburină rapidă, pe multe alte melodii Moodies care au continuat să fie prezentate, plus muzicuță ocazională), iar în acest moment a fost în mare parte retrogradat la statutul de cântăreț de rezervă. Ray Thomas a fost, de asemenea, rău în această perioadă, limitându-și în continuare implicarea cu trupa în studioul de înregistrări. El a oferit câteva coruri atât pentru cealaltă parte a vieții, cât și pentru Sur La Mer; cu toate acestea, considerațiile multiple de producție l-au determinat pe Visconti să lase vocea lui Ray Thomas în afara ultimului dintre aceste două albume, reducând astfel și mai mult textura sunetului lor vocal general, care fusese bogat în armonii în patru părți, apoi a coborât la trei, acum redus și mai mult doar la vocile mai asemănătoare ale lui Justin Hayward și John Lodge (John Lodge oferind, de asemenea, voci falsetto și armonii înalte), Mike Pinder și Ray Thomas fiecare oferind atât armonii vocale inferioare, cât și înalte în sunetul vocal anterior al grupului. „Sunetul” vocal al trupei devenise amestecul doar Justin Hayward-John Lodge, care era încă recunoscut, dacă era mai puțin texturat decât sunetul „Coral” original în patru părți, mai complex.

1990 pentru a prezenta
plecarea lui Patrick Moraz
valoarea ridicată a lui Ray Thomas a rămas pe scenă în primul rând datorită capacității sale continue de a-și cânta clasicele Moodies din anii 1960 și 1970 și, de asemenea, în duete de flaut și tastatură pe care le-a compus cu Moraz, care au fost interpretate doar de cei doi în timpul concertelor lui Moodies. Trupa începuse să-și consolideze sunetul concertului în 1986 cu adăugarea unui al doilea tastaturist (Bias Boshell a fost primul, înlocuit în 1987 de Guy Allison înainte ca Boshell să se întoarcă până în 1990), precum și cântărețe de sex feminin.în 1991, la jumătatea producției noului lor album de studio, Patrick Moraz a făcut câteva comentarii într-un articol din revista Keyboard care sugera nemulțumirea față de rolul său în Moodies. Plângerile sale au variat de la muzica Moodies devenind prea simplă în structură, până la reticența celorlalți membri de a-i permite să aducă contribuții semnificative la compoziția albumelor lor. De asemenea, a petrecut mult timp planificând un concert de muzică pentru a sărbători cea de-a 700-a aniversare a Elveției sale natale, în loc să repete cu Moodies. El a fost demis de la participarea ulterioară la grup înainte de finalizarea proiectului. Boshell și Noul tastaturist Paul Bliss au fost aduși pentru a termina piesele de tastatură ale noului album. În ciuda faptului că creditele ca ” membru oficial al trupei „au fost incluse în orice fotografie de grup de pe cele patru albume de studio din anii ’80, de la” Long Distance Voyager „la” Sur La Mer „în ultimii ani, compilațiile Moodies se referă acum la Moraz ca fiind doar un” tastaturist suplimentar”, Moraz a luat mai târziu măsuri legale împotriva grupului din Statele Unite, pe care le-a câștigat, dar apoi i s-au acordat doar 90.000 de dolari în plată din cauza încetinirilor contabile în loc de cei 4.000.000 de dolari pe care îi cerea.cheile regatului (1991) au avut un succes comercial modest. Încă o dată, melodiile lui Justin Hayward au condus albumul, cu noile single-uri „Say It With Love” și „Bless the Wings (That Bring you Back)”. De asemenea, a fost inclusă o nouă piesă de flaut ambientală de Ray Thomas intitulată „Celtic Sonant. Justin Hayward și Ray Thomas au scris ,de asemenea,” Never Blame the Rainbows for the Rain ” pentru a închide albumul. John Lodge va face o schimbare definitorie în compoziția sa pe acest album, lăsând marca sa muzică rock de mare energie și, în schimb, gravitând spre balade de dragoste lente, cum ar fi „Lean on Me (Tonight)” (deși a contribuit mai devreme cu câteva melodii în această venă mai blândă, cum ar fi „Emily’ s Song” pentru fiica sa în 1971 și „Survival” în 1978, plus „Talking out of Turn” în 1981), în timp ce melodiile mai puternice ale lui John Lodge au continuat cu „Magic” și Lennonesque „umbre pe perete”. Această tendință mai blândă va continua pe cele două albume succesive Moodies. Justin Hayward a scris piesa de conducere din două părți”spune ce vrei să spui”. Tony Visconti a produs unele dintre piesele de pe” Keys”, la fel ca Christopher Neil și Alan Tarney. Turneul care a urmat i-a văzut invitați să cânte la Festivalul de jazz Montreux. Un non-album Justin Hayward – John Lodge piesa tăiată la aceste sesiuni, „Highway”, a fost inclusă pe single-ul „Say It With Love” de doisprezece inci și pe un set de cutii ulterior, în timp ce albumul de vinil nu a inclus piesa lor „Once is Enough” ca pe versiunea compact disc.grupul a rămas un concert constant, iar o serie de versiuni video și audio ale concertului lor din 1992 Night at Red Rocks s-au bucurat de un mare succes, în special ca o strângere de fonduri pentru televiziunea publică americană, unde fusese difuzată pentru prima dată. Concertul a fost condus și aranjat de Larry Baird, care a participat la concertele orchestrale live ale multor alte trupe, precum Kansas, Michael Bolton, Three Dog Night, Al Jarreau și Alan Parsons. Grupul și-a continuat, de asemenea, utilizarea de muzicieni suplimentari pe scenă și în studio. După cele două procese legale de la ambele Mike Pinder în 1981 și Patrick Moraz în 1992, trupa a avut grijă să nu recunoască viitorii jucători de tastatură ca membri oficiali. În urma contribuțiilor sale ca tastaturist pe’ Keys of the Kingdom ‘ album, Paul Bliss a cântat la clape pentru trupă live din 1991, fiind promovat la primul tastaturist în 2001 (dar de atunci a fost înlocuit în martie 2010 după 19 ani de serviciu continuu cu trupa). Ray Thomas și Bliss au continuat tradiția unui duet de flaut / tastatură pentru multe turnee. După ce Graeme Edge s-a rănit în 1991, al doilea baterist Gordon Marshall a fost adus pentru a-l susține; a rămas cu grupul după ce Graeme Edge și-a revenit și a rămas în poziție de atunci.

Strange Times, turnee din anii 1990
din 1991 până în 1998, grupul a luat o pauză de la înregistrare și a petrecut timp încercând să perfecționeze arta interpretării live cu o orchestră. Pauza de înregistrare S – a încheiat în 1999, cu albumul Strange Times, care s – a dovedit a fi primul album al grupului în aproape două decenii care a fost primit mai mult decât moderat de criticii britanici, deși Justin Hayward a fost citat spunând că a fost dezamăgit de performanța albumului-probabil că nu a fost ajutat de lunga pauză de înregistrare-care a fost în special mai mică decât ‘Keys of the Kingdom’ în 1991. A fost înregistrat în Recco, Italia, la sugestia lui Justin Hayward și a fost primul efort auto-produs al trupei. Albumul a inclus, de asemenea, tastaturi și aranjamente de la muzicianul Italian Danilo Madonia, care a lucrat în studio cu trupa de atunci. Albumul s-a deschis cu English Sunset, o melodie pop cu un aranjament modern, aproape techno. Piesa This is the Moment (care nu este pe Strange Times), care a fost inițial prezentată în producția de pe Broadway a lui Jekyll și Hyde, a fost un hit minor în SUA. Strange Times a fost, de asemenea, primul album din 1970 care a inclus un nou poem de Graeme Edge, nimic nu se schimbă, povestit de Graeme Edge însuși, Justin Hayward cântând apoi porțiunea finală a piesei și încheiată în special citând Mike Pindertitlul melodiei din 1968 un joc simplu. Tot în 1999, Moody Blues a apărut într-un episod din Simpsonii numit Viva Ned Flanders. Pe vremuri ciudate Ray Thomas a apărut vocal cu Justin Hayward și John Lodge mai devreme sau mai târziu (Walkin’ On Air) și propria sa melodie scurtă Micul meu minunat, plus a oferit un fragment vocal și coruri pe Justin Hayward ‘ s Apus de soare englezesc; acestea s-ar dovedi a fi cântecul său de lebădă vocală înregistrat cu trupa.în 2000, trupa a lansat Hall of Fame, un nou concert live de la Royal Albert Hall, cu o lansare simultană pe DVD. Acest lucru a fost luat din ultimul turneu pe care a jucat Boshell. A părăsit formația live în 2001; Bliss a preluat primele sarcini de tastatură, cu fostul său al doilea rol de tastatură ocupat de Bernie Barlow și Julie Ragins când Barlow a luat concediu de maternitate din 2006 până în 2009.în 2001, a fost lansat un film IMAX, intitulat călătorie în peșteri uimitoare, care conținea două piese noi scrise și interpretate de Moody Blues. Coloana sonoră a prezentat, de asemenea, Justin Hayward interpretând voce și cântând la chitară pe tot parcursul. Una dintre aceste melodii, intitulată apă, este prima înregistrare instrumentală a studioului Moody Blues de la piesa lor din 1983 gaură în lume din actualul LP.

Ray Thomas se retrage, decembrie 2002
noul mileniu a văzut Moody Blues reducându-și programul de turnee. La sfârșitul anului 2002, membru fondator Ray Thomas s-a retras din grup, reducând Moody Blues la trio-ul Justin Hayward, John Lodge și Graeme Edge, ultimul fiind singurul membru original rămas. Flautistul și chitaristul ritmic Norda Mullen a fost recrutat la începutul anului următor pentru Turneul lor din America de Nord și a lucrat cu trupa live și în studio de atunci. Spre sfârșitul anului 2003, au lansat un album intitulat decembrie. Piesele au inclus originale și patru coperte: „Happy Xmas (War Is Over)” de John Lennon, „a winter ‘ s Tale” de Mike Batt, „When A Child is Born” și „White Christmas”de Irving Berlin. Decembrie a fost primul album al grupului care a inclus coperte de la albumul lor de debut din 1965 The Magnificent Moodies.
În martie 2006, primele cinci albume ale trupei’ Core Seven ‘ (cele șapte albume de la Days Of Future au trecut la Seventh Sojourn) au fost relansate în format SACD cu ediții Deluxe, cu melodii bonus și câteva piese rare inedite anterior de către grup. În aprilie 2007, ultimele două dintre aceste albume clasice au fost relansate de Universal/Threshold. Aceste ediții de lux au fost unice pentru un grup de art rock precum Moodies, în sensul că unul dintre membrii lor, Justin Hayward, a fost cel care a preluat munca, în loc de un tehnician maestru profesionist. Justin Hayward a declarat că a ascultat copii Virgine de vinil ale acestor albume și le-a folosit ca puncte de referință pentru noile discuri compacte. În septembrie 2008, Justin Hayward a anunțat lansarea iminentă a versiunilor remasterizate ale Octave, Long Distance Voyager și prezentul, care vor fi lansate pe Universal Records în lunile următoare. La 21 Mai 2007 Moodies a lansat o patruzeci și unu de piese, compilație pe două discuri de sesiuni înregistrate la studiourile BBC, diverse apariții la televiziune și o performanță pierdută anterior în emisiunea Tom Jones intitulată Live la BBC: 1967-1970.