istoria administrației din Karachi începe în 1846, când o epidemie de holeră a amenințat 9.000 de cetățeni ai orașului. Eforturile de combatere a acestei boli infecțioase au fost coordonate de un consiliu de conservare. În 1852, Consiliul de conservare a devenit o comisie municipală și în 1853, a fost modernizat la Comitetul Municipal. În 1878, orașul a fost împuternicit să colecteze impozite la nivel local.legea municipală a orașului Karachi a fost promulgată în 1933, iar Comitetul Municipal a devenit o corporație Municipală multietnică de 57 de membri, cu un președinte și un vicepreședinte în locul fostului primar și viceprimar. Primul președinte a fost Jamshed Naserwanji, care a servit anterior ca primar timp de douăzeci de ani.

după independență în 1947, Karachi a devenit capitala noului stat independent al Pakistanului, iar primarul Hakim Ehsan l-a primit pe Guvernatorul General, Muhammad Ali Jinnah, la Aeroportul Internațional Karachi. În 1948, granițele orașului au fost fixate în noul teritoriu al Capitalei Federale, care acoperea 2.103 km2, dar includea și câteva orașe mici și sate separate de Karachi.

în perioada 1961-1970, fostul teritoriu federal al Capitalei a fost fuzionat cu statul Princiar vecin Las Bela pentru a forma Divizia Karachi-Bela din Pakistanul de vest. În anii 1970, această fuziune a fost inversată și Karachi a devenit o divizie în sine, acoperind 3.528 km2.Corporația Municipală Karachi a fost modernizată la o corporație metropolitană în 1976, urmată de comitetele municipale zonale care funcționează în perioada 1987-1994. Sistemul de guvernare s-a schimbat din nou în 1996, când Diviziunea Karachi a fost împărțită în cinci districte, fiecare cu propria corporație Municipală.

în 1999, Președintele Pervez Musharraf sa angajat la o revizuire a întregii structuri administrative a țării. În anul 2000, întregul al treilea nivel al Guvernului (diviziuni administrative) a fost desființat în favoarea celui de-al patrulea nivel (districte). În Karachi, Divizia Karachi și cele cinci districte au fost fuzionate pentru a forma un nou oraș-District care a fost împărțit în August 2001 în optsprezece orașe autonome cuprinzând 178 de consilii locale ale Uniunii.

sistemul orașului a fost desființat în 2011, iar Autoritatea de dezvoltare Karachi este condusă la nivel provincial, mai degrabă decât local.