w dniu pobrania jaja embriolodzy preferują, aby partner płci męskiej zbierał przy owacji płodność Austin (OVA), jeśli to możliwe. Powodem tego jest to, że próbka nasienia może być zanieczyszczona bakteriami, gdy jest pobierana, bez względu na to, gdzie jest pobierana. Tak więc najlepiej jest jak najszybciej rozpocząć procedurę mycia plemników, aby usunąć wysokiej jakości plemniki z osocza nasiennego, które mogą zawierać bakterie.

około godziny po przyjeździe pary do Austin Fertility Surgical Center rozpocznie się pobieranie jaj. Pielęgniarki odwiozą partnerkę z powrotem do sali zabiegowej, gdy partnerka czeka w ich pokoju. Jeśli mąż zamierza pobrać próbkę nasienia z komórki jajowej, embriolog przyjdzie po partnera w tym czasie. Partner płci męskiej dostarczy embriologowi dokument tożsamości ze zdjęciem, a następnie zostanie odprowadzony do sali zbiórki przez embriologa. Po zebraniu próbki, partner wraca do pokoju pary i czeka, aż partner wróci z jej pobierania jaj.

bardzo ważne jest, aby pacjenci pobierali próbkę nasienia przez masturbację, aby uniknąć kontaktu z jakimkolwiek płynem ustrojowym od mężczyzny lub partnerki. Dzieje się tak dlatego, że wszystkie płyny ustrojowe (ślina, płyny pochwowe) zawierają bakterie. Bakterie te mogą uszkodzić plemniki w małych ilościach. W procedurze zapłodnienia in vitro pojawia się dodatkowy problem z zanieczyszczeniem bakteryjnym. Oznacza to, że podczas inseminacji umyte plemniki zostaną umieszczone w małej kropli z jajami przez 18 godzin. Ten proces inseminacji odbywa się w inkubatorze, który znajduje się w temperaturze ciała. To ciemne, wilgotne środowisko sprzyja rozwojowi bakterii i powoduje obumieranie jaj w kulturze. Jest to bardzo różni się od techniki zapłodnienia wewnątrzmacicznego, gdzie plemniki muszą przepłynąć przez płyny tkankowe macicy i do jajowodów, zanim dotrą do miejsca, w którym znajduje się jajo. To podróżowanie przez płyny pomaga rozcieńczyć lub całkowicie zmyć wszelkie bakterie, które są obecne wokół plemników.

problem jest jeszcze gorszy, gdy wstrzyknięcie wewnątrz cytoplazmatyczne (ICSI) musi być użyte do osiągnięcia zapłodnienia. W tej technice plemniki są wstrzykiwane bezpośrednio do każdego jaja. Jeśli wokół nasienia znajdują się bakterie, zostaną one pobrane za pomocą pipety do wstrzykiwania nasienia i wstrzyknięte bezpośrednio do jaja. Bakterie są tak małe, że mogą nawet nie być widoczne i spowodują śmierć jaja.

kolejnym problemem związanym z pobieraniem nasienia do in vitro jest smar, który można stosować podczas masturbacji. Smar, który jest dostępny w komórkach jajowych jest nietoksyczny dla plemników. Jest to bardzo ważne dla utrzymania plemników pływających podczas procesu inseminacji. Inne płyny są prawie zawsze toksyczne i zabijają lub wyłączają plemniki w czasie, który jest bardzo krytyczny dla powodzenia procedury. Te substancje chemiczne, które są obecne w płyny mogą być również prowadzone z plemników do jaj i zabić lub poważnie zranić je.

gdy partner płci męskiej pobiera próbkę nasienia w komórkach jajowych za pomocą dostarczonego smaru, jest on narażony na mniejsze zagrożenia środowiskowe i jest badany i przetwarzany w odpowiednim czasie po jego pobraniu.