Frontiers in Genetics
Introduction
ショートタンデムリピート（STRs）は、ヒトゲノムの約3％を占めるDNA（2-6bp）の短い反復配列である（Lander et al., 2001). 繰り返し単位の数は識別の目的のために分析されたとき差別の高い力を提供する個人間で非常に可変的である。 Ｓｔｒは本質的に非コードであり、したがって遺伝子発現に関与していないということは広く受け入れられている概念である（Ｔａｕｔｚ ａｎｄ Ｓｃｈｌｏｔｔｅｒｅｒ，１ ９ ９ ４；Ｒａｍｅｌ，１ ９ ９ ７；Ｂｕｔｌｅｒ，２ ０ ０ ６；Ｂｉｓｃｏｔｔｉ ｅ ｔ ａ ｌ．，１ ９ ９ ８；Ｂｕｔｌｅｒ，１ ９ ９ ９；ｂｕｔｌｅｒ，１ ９ ９ ９；ｂｉｓｃｏｔｔｉ ｅ ｔ ａ ｌ．，１ ９ ９ ９；, 2015). しかしながら、Ｓｔｒのような非コードＤＮＡ配列は、様々な機構を介して遺伝子調節に関与し、したがって表現型に関連しているという証拠が増加している（Ｓａｗａｙａ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ １ ３；Ｃｈｅｎ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2016).法医学ケースワークで使用される最初のSTRマーカーは、1994年に英国のForensic Science Service（FSS）によって、四つのテトラヌクレオチドSTRs—TH01、vWA、FES/FPS、およびF13A1からなる四重, 1994). これらのマーカーは、単純な反復配列と四つの塩基によって異なる等間隔の対立遺伝子を表示する傾向のためにPCR増幅に適していると考えられたが、quadruplexシステムは高いレベルの差別を提供していなかった。 1997年、連邦捜査局（FBI）は、連邦、州、および地方の法医学研究所によって提供されたプロファイルからなるデータベースであるCombined DNA Index System（CODIS）の中核を形成するために13の常染色体STR遺伝子座を指名した。 ＦＳＳによって最初に選択された２つのマーカー（ＶＷＡおよびＴ Ｈ０ １）は、コアＣＯＤＩＳセット内に含まれたが、ＦＥＳ／ＦＰＳおよびＦ１ ３Ａ０ １は、低レベルの多型のために最終的に廃棄さ コアセットは2010年に見直され、1月から2017年にかけて追加のSTRsが実装された。 市販のＤＮＡプロファイリングキットの大部分は、コアＣＯＤＩＳ ＳＴＲ遺伝子座を含むように製造されている（Ｂｕｔｌｅｒ，２ ０ ０ ６）。 1994年のDNA Identification Actに従って、CODISは、保存されたDNAサンプルおよびその後の分析が法執行機関の識別目的のために厳密に使用されるという点で、厳格なプライバシー保護プロトコルによって拘束されている。 2000年のDNA分析バックログ除去法は、彼らが任意の既知の物理的特性や医療特性に関連付けられていることが知られていないので、法医学的用途に使
CODISに指名されたマーカーは、ゲノムの非コード領域内の位置のために特異的に選択されたが、非コード領域が機能的役割を果たさないという主張は、近年 特定のSTR対立遺伝子と病状との間に関連がある可能性があるという証拠が増えている（von Wurmb-Schwark et al. ら，２ ０ １ １；Ｍｅｒａｚ−Ｒｉｏｓら，２ ０ １ ２．, 2014). これは、対立遺伝子または遺伝子座が病状（例えば、トリソミー）の診断である状況と混同すべきではない。 さらに、法医学的Ｓｔｒから生物地理学的祖先（ＢＧ ａ）を推測する能力が可能である（Ｇｒａｙｄｏｎ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ ０ ９；Ａｌｇｅｅ−Ｈｅｗｉｔｔ ｅ ｔ ａ ｌ． 調査者は、調査を導くための知性として人口固有のSTRデータを使用している（Lowe et al., 2001). ＢＧＡは、ヨーロッパ人の青い目の色のようないくつかの表現型と相関している（Ｇｅｔｔｉｎｇｓ ｅ ｔ ａ ｌ．、2014）と赤道からの距離の増加に伴う明るい肌の色（Relethford、1997）。 しかし、STR遺伝子型自体は、直接的な意味でのBGA表現型の原因ではなく、遺伝的ドリフトの結果としてのBGAとほとんど関連している（法医学的使用のためのStrは、ハーディ・ワインバーグ平衡を示すように選択されているため）。 将来、CODISマーカーが病状または身体的形質に関連していることが判明した場合でも、DNAサンプルの分析は、1994年のDNA同定法に従って同定目的にのみ使用され
Katsanis and Wagner(2013)は、表現型の関連について24のCODIS遺伝子座を評価しましたが、生物医学的に関連する情報の開示を支持する証拠は見つかりませんでした。 例えば、遺伝子座TH01は、アルコール依存症から脊髄小脳失調症までの18もの形質と関連していたという事実にもかかわらず、これらの形質との関連は、個々の遺伝子型が特定の形質の原因または予測であることを必ずしも意味するものではないと述べている。 これに続いて、SCIENTIFIC Working Group OF DNA Analysis Methods（2013）が発表した声明では、将来別の発見が行われるかもしれないが、現在の理解では、CODIS遺伝子座は身元を超えた情報を明らかにしていないということが再表明されている。 ヒト同一性試験で使用されるマーカーとしての考慮から除外されたSTRはこれまでに1つだけであった（Szibor et al., 2005). STR遺伝子座HumARAはX染色体上のコード領域内に位置し、筋ジストロフィーにリンクされています。 Ｈｕｍａｒａはトリヌクレオチドリピートであり、これらはテトラヌクレオチドリピートよりも疾患を引き起こす拡張を起こしやすいことが知られている（Ｏｒｒ ａｎｄ Ｚｏｇｈｂｉ，２ ０ ０ ７；Ｃａｓｔｅｌ ｅ ｔ ａ ｌ．,2010;阪南,2018).
材料と方法
2018年8月から12月にかけて、3つのデータベース（Web of Science、PubMed、Google Scholar）で文献の体系的な検索が行われました。 集団データ研究、対立遺伝子頻度研究、検証研究、技術開発、単一の症例報告、突然変異解析、オフラダー対立遺伝子同定、ヘテロ接合性研究の損失、および遺伝子座の特徴付けは除外された。 追加の論文は、関連する研究または類似の研究を参照することによって配置されました。 文献検索の後、各ＳＴＲは、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏ ｆ Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ（ＵＣＳＣ）ゲノムブラウザ（ヒトＧｒｃｈ３ ８／ｈｇ３ ８アセンブリ）において、以下のトラックを使用して分析された：Ｍａｐｐｉｎｇ ａｎｄ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ−Ｂａｓｅ Ｐｏｓｉｔｉｏｎ−ｄｅｎｓｅ）。; STSマーカー-フル、遺伝子および遺伝子予測-GENCODE v29-フル;NCBI RefSeq-パック、表現型および文献—OMIM対立遺伝子-フル;OMIMフェノ遺伝子座-フル;OMIM遺伝子-フル;HGMD変異体-フル;GWASカタログ-フル、規制—エンコード規制-ショー;RefSeq Func Elems-フル、変異—共通SNPs(151)-フル;FlaggedSNPs(151)-フル、リピート—マイクロサテライト-フル;シンプルなリピート-フル。 調査されたSTRsには、FBIによって使用されている20個のCODISコア遺伝子座、オーストラリアで現在使用されている三つの余分な遺伝子座（Penta E、Penta D、D6S1043）、およびドイツ国立データベースのコアSTRであり、その後いくつかのヨーロッパのキットに組み込まれているSE33が含まれていた。
結果と議論
三つのデータベースから供給された57の関連研究の合計は、STR包括的な遺伝子と表現型との間の報告されたリンクと0.05未満のp値 五十のユニークな形質は、24マーカーにわたって同定された（補足表1）。 統合失調症は、潜在的に八遺伝子座に関連する14の異なる多型に関するデータを報告する11の研究の合計で最も頻繁に記述された形質であった。 二つの別々の記事は、自殺を試みた人々の間で対立遺伝子の頻度を調査し、七つの法医学的遺伝子座の10の異なる対立遺伝子の中で有意に高い頻度を報 イントロンSTR TH01は、潜在的に40の異なる遺伝子型にリンクされている27の形質を記述する26のレポートとの研究の最大数を持っていた。 これらの研究のうち5つは、統合失調症との関連性を調査しており、この疾患に関連する可能性のある5つの多型を報告していました。 対立遺伝子または遺伝子型を表現型と関連付ける研究は、Ｐｅｎｔａ Ｅ、Ｐｅｎｔａ Ｄ、Ｄ３Ｓ１ ３ ５ ８、ＳＥ３ ３、またはＤ１ ０Ｓ１ ２ ４ ８について見出されなかった；しかし、Ｓｈｉらによる１つの研究。 (2012)は、21番染色体上に位置するPenta D遺伝子座のトリソミーを検査することにより、ダウン症候群を診断する方法を検討した。 同様に、D21S11のために含まれている10の記事の六つは、ダウン症候群の遺伝子検査におけるマーカーの効率を調査していました。
法医学的STRと表現型との関連を提案する57の記事のうち、それらのどれも特定の遺伝子型が表現型の原因であることを確認しなかった。 STRsのうち13個が機能的遺伝子内に位置しているにもかかわらず、これらの遺伝子のSTRを含む領域を疾患と関連させるOnline Mendelian Inheritance in Man（OMIM）データベースにはエ 顕著な結果は、TH01遺伝子座における多型と表現型との間の関連を報告する研究の数である。
TH01
TH01は、チロシンヒドロキシラーゼ（TH）遺伝子の最初のイントロン内に位置し、一般的にGenBank top strand nomenclatureによると、リピートモチーフnまたは代わりにnモチ THはカテコールアミンのドーパミン、エピネフリンおよびノルエピネフリンの生合成にかかわる律速酵素です。 カテコールアミンは、恒常性の維持を助ける神経伝達物質およびホルモンの両方として作用する（Eisenhofer et al., 2004). このように、強い関係が文献で報告されている（Ｅｉｓｅｎｈｏｆｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ． ら，２ ０ ０ ４；Ｎｇ ｅ ｔ ａ ｌ． THの発現の変化と神経学的、精神医学的、および心血管疾患の発症との間の2015）。
以前の研究（McEwen、2002;Antoni et al。 ら，２ ０ ０ ６；Ｂａｓｔｏｓら，２ ０ ０ ６；Ｂａｓｔｏｓら， ら、2018）は、急性または慢性ストレスを経験している個体において、エピネフリンおよびノルエピネフリンのレベルの上昇が発現することを示している。 魏ら (1997)は、TH01-9対立遺伝子を保有する個体が、無関係の健康な成人の集団の中で血清ノルエピネフリンの最高レベルを示し、一方、TH01-7対立遺伝子の保 Barbeau et al. (2003)は、安静時および適用されたストレッサーに応答して、被験者におけるTH01繰り返しの数と血行力学的パラメータとの関係を調査した。 この研究の結果は、6および9.3TH01対立遺伝子は、それらの対立遺伝子を運ぶ個人に保護効果を提供し、ストレスに対する血行力学的応答の減少に関 TH01-6対立遺伝子のキャリアは、TH01-6対立遺伝子のないものよりも年齢の増加とストレッサーにさらされたときに低い心拍数反応性を示した。 さらに、TH01-9を運ぶ個人。3th01-9.3対立遺伝子を所有していないものは、年齢の増加と収縮期血圧反応性の有意な増加を示したのに対し、ストレスに応答して収縮期血圧の増加 逆に、TH01-7対立遺伝子はより大きい体格指数（BMI）とのそれらの血圧にとって有害であるために見つけられました。 TH01-7を運ぶ被験者は、BMIが増加し、bmiの増加とストレッサーに応答して心拍数の反応性を増加させるにつれて、より高い安静時収縮期血圧を表示した。
TH01-7はまた、うつ病になりやすい患者において有意に一般的であることが報告された（Chiba et al., 2000). ＴＨ０ １−８対立遺伝子は、自殺企図者においてより頻繁に発見された（Ｐｅｒｓｓｏｎ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、１ ９ ９ ７）、うつ病を有する個体（Ｓｅｒｒｅｔｔｉ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、１ ９ ９ ８）、および妄想障害を有する個体（Ｍｏｒｉｍｏｔｏ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2002). Persson et al. (2000)は、TH01繰り返しの数が30個の人格次元に及ぼす影響を調査した。 TH01-8対立遺伝子を有する被験者は、怒り、敵意および脆弱性を示す個人間で観察された有意差を伴う神経症面でより高いスコアを記録した（Persson et al. ら、２ ０ ０ ０）、非ＴＨ０ １−８対立遺伝子担体と比較した。 ＴＨ０ １遺伝子座での９つの反復は妄想障害と関連していた（Ｍｏｒｉｍｏｔｏ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ ０ ２）および外向性（Ｔｏｃｈｉｇ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2006). さらに、Ｙａｎｇ ｅ ｔ ａ ｌ． （2011）は、中国での関連研究の数を実施し、TH01-9の頻度ことを報告しました。3は自殺行動を示すもので高く、TH01-10は性的暴行を含む暴力的な行動を示す個人で有意に過剰表現された（Yang et al.、2010）および衝動的な暴力的行動を有する男性において（Yang et al., 2013). ＴＨ０ １はまた、統合失調症などの様々な疾患状態に関連していた（Ｊａｃｅｗｉｃｚ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ ０ ６ｂ）、マラリア素因（Ｇａｉｋｗａｄ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ ０ ５；Ａｌａｍ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ １ １）、乳幼児突然死症候群（ＳＩＤＳ）（Ｋｌｉｎｔｓｃｈａｒ ｅ ｔ ａ ｌ． Ｃｏｕｒｔｓ ａｎｄ Ｍａｄｅａ，２ ０ １ １）、およびＰａｒｋｉｎｓｏｎ病（Ｓｕｔｈｅｒｌａｎｄ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2008).
前述のように、THはチロシンのレボドパ（L-DOPA）への変換を触媒し、その後ドーパミンに変換される。 ドーパミンはさらにノルエピネフリンとエピネフリンに変換することができます。 Ｉｎ ｖｉｔｒｏ実験では、ｔｈ０ １がｔ ｈ遺伝子転写を調節し、定量的サイレンシング効果を示すことが以前に実証されている（Ａｌｂａｎｅｓｅ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2001). TH01対立遺伝子は、繰り返しの数に比例して転写を阻害した。 非常に多くの重要な機能がドーパミンとその代謝産物の存在に依存していることを考えると（Wei et al. ら、１ ９ ９ ７；Ｍｅｉｓｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ １ ３）、ドーパミン作動性経路の機能不全は、多数の心理的疾患の発症に関連している（Ｍｅｉｓｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ．，２ ０ １ ３）。 このレビューでは、TH01は主に統合失調症と関連していた（Kurumaji et al. ら、２ ０ ０ １）およびＰａｒｋｉｎｓｏｎ病（Ｍｅｉｓｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2013). より長いth01-9.3およびTH01-10対立遺伝子は、より少ないドーパミンをもたらすと予測され、衝動的な暴力的行動などのドーパミン作動性機能不全を示す形質を示す個体においてより頻繁に見出された（Yang et al. 2013年）、性的暴行（Yang et al. ら、２ ０ １ ０）、および嗜癖（Ｓａｎｄｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、１ ９ ９ ８；Ａｎｎｅｙら、１ ９ ９ ８；Ａｎｎｅｙら、, 2004).
いくつかの矛盾した関連付けは、TH01と特定の表現型の間に観察されました。 例えば、Ｄｅ Ｂｅｎｅｄｉｃｔｉｓ ｅ ｔ ａ ｌ． (1998)は、イタリアの男性百歳の長寿と>9TH01リピートの重要な関連性を報告しました。 対照的に、ｖｏｎ Ｗｕｒｍｂ−Ｓｃｈｗａｒｋ ｅ ｔ ａ ｌ． (2011)は、Bediagaらと同じように、ドイツの人口に同じ研究デザインを使用すると、この結果を複製することができませんでした。 （2015）はまた、スペイン北部の人口に関連することを確認することができませんでした。 同様に、TH01-9の関連については矛盾する報告があります。ヨーロッパの人口を渡るSIDSとの3。 2008年、Klintschar et al. (2008)は、TH01-9.3対立遺伝子の頻度がドイツの集団の対照よりもSIDS患者で有意に高かったことを見出した。 この協会は、裁判所とMadea（2011）によってさらに確認されました。 それどころか、Studer et al. （2014）は、スイスの人口でこの結果を複製することができませんでした。 さらなる集団ベースの関連研究は、TH01とこれらの表現型との間の関連の存在を確認するために必要とされる。
TH01を調査した研究のいずれも、関連する遺伝子型のいずれかが疾患の原因であると同定されていないため、言及された関連性は可能性または可能性としてのみ考慮されるべきである。 TH01に関連すると報告されている形質の多くは多因子性であり、パーキンソン病の場合など、遺伝子と環境の両方によって影響されることを意味する（Meiser et al. ら、２ ０ １ ３）および統合失調症（Ｚｈｕｏ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2019).
他のSTRマーカーの潜在的な関連
統合失調症は、妄想、幻覚、および社会的認知障害を特徴とする複雑な遺伝性精神健康障害である。 統合失調症は多遺伝子であり、疾患負担対立遺伝子は複数の遺伝子座にわたって分布していることが理解される（Giusti-Rodríguez and Sullivan,2013;Zhuo et al., 2019). この概念と一致して、我々の研究では、統合失調症が最大数のStrと関連していることが明らかになった：FGA、TH01、vWA、D2S441、D2S1338、D8S1179、D16S539、およ １つの研究（Ｊａｃｅｗｉｃｚ ｅ ｔ ａ ｌ．、2006a）は、D18S51およびD2S1338におけるより長い反復が、対照よりも患者において有意に頻繁であることを見出した。 この傾向は、他の主要な精神疾患におけるトリヌクレオチドリピートの拡大と一致している。 この疾患の固有の複雑さは研究者に挑戦をもたらしてきたが、神経伝達物質の異常は、統合失調症の病因における主要な寄与因子として長い間認められてきた(Mäki et al. ら，２ ０ ０ ５；ＭｏｄａｉおよびＳｈｏｍｒｏｎ，２ ０ １ ６）。
遺伝的変異だけでは、統合失調症の発症と発症を引き起こすには十分ではありません。
; 従って、遺伝の危険率が条件の開発、手始めおよび進行の環境の危険率といかに相互に作用するか探検するためにそれ以上の研究は要求されます。
静脈血栓塞栓症（VTE）は、深部静脈血栓症および/または肺塞栓症の発生によって定義される疾患である。 ＶＷＦは、凝固中の血小板接着において役割を果たす糖タンパク質であり；従って、ＶＷＦの血清レベルの変化が血栓症障害に寄与し得ることが理解される（Ｌａｉｒｄ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2007). Meraz-Rios et al. ら（２ ０ １ ４）は、Ｖｗａ−１ ８、ＴＰＯＸ−９、およびＴＰＯＸ−１ ２が、メキシコのメスティーゾ集団における静脈血栓症を有する個体においてより頻繁に観察されたことを見出した。 さらに、ＶＷＡおよびＴＰＯＸは、慢性骨髄性白血病と関連している（Ｗａｎｇ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2012).
トリソミー
ダウン症候群、またはトリソミー-21は、21番染色体に第三の対立遺伝子が存在することによって診断することができます。 このトリソミーは、21番染色体上に見出される任意の多型マーカーに存在することができ、ダウン症候群検出における有効なマーカーとしてのD21S11およびPenta Dの使用を評価するいくつかの研究がある（Yoon et al. ら、２ ０ ０ ２；Ｌｉｏｕら、２ ０ ０ ３；Ｌｉｏｕら、 ら，２ ０ ０ ４；Ｓｈｉ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ １ ２；Ｇｕａｎ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2013). 同様に、Ｄ１ ８Ｓ５ １およびＤ１ ３Ｓ３ １ ７を、それぞれＥｄｗａｒｄｓ症候群（Ｔｒｉｓｏｍｙ−１ ８）およびＰａｔａｕ症候群（Ｔｒｉｓｏｍｙ−１ ３）の存在を診断するための遺伝子マーカーとして使用することができる。 トリソミーは、3つの染色体を持つすべての個体が影響を受けるため、因果関係の例です。 染色体13、18、または21の余分な対立遺伝子の存在は、ドナーに未知の病状を明らかにしないが、それは研究者に追加の識別可能な情報を提供する。
Cancer
法医学的STRsは、癌関連対立遺伝子をスクリーニングするためのいくつかの研究で遺伝子マーカーとして使用されている。 Huiら。 （２ ０ １ ４）は、２対の対立遺伝子（Ｄ５Ｓ８ １ ８−１ ３を有するＤ８Ｓ１ １ ７ ９−１ ６およびＤ６Ｓ１ ０ ４ ３−１ １を有するＤ２Ｓ１ ３ ３ ８−２ ３）が、胃癌患者においてより頻繁に発見されたことを見出した。 さらに、中国からの研究では、d6S1043におけるホモ接合性対立遺伝子と浸潤性子宮頸癌のリスク増加との間に有意な関連性が同定された（Wu et al., 2008). ヘテロ接合性の喪失（LOH）は、ヘテロ接合性遺伝子の1つのコピーの喪失をもたらす遺伝的変異であり、しばしば機能的腫瘍抑制遺伝子の喪失による癌 異なる癌組織におけるＬＯＨは、喉頭癌患者において、ＣＳＦ１ＰＯ、ＦＧＡ、ＶＷＡ、Ｄ３Ｓ１ ３ ５ ８、Ｄ５Ｓ８ １ ８、Ｄ８Ｓ１ １ ７ ９、Ｄ１ ３Ｓ３ １ ７、およびＤ１ ８Ｓ５ １などの多数の法医学的遺伝子座で観察されている（Ｒｏｇｏｗｓｋｉ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2004). ＬＯＨは、ＤＮＡプロファイルの結果を変えることができ、癌性組織のみが分析のために利用可能である場合に考慮されるべきである（Ｐｅｌｏｓｏ ｅ ｔ ａ ｌ． ら、２ ０ ０ ３；Ｚｈｏｕ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2017).
Qiら。 (2018)は、肺および肝臓癌の素因をスクリーニングするために、関連遺伝子ではなく遺伝子マーカーを使用する可能性を調査する研究を実施した。 本研究では、慢性疾患の発生は年齢に依存せず、代わりにプログラムされた発症パターンに依存する可能性があると仮定するプログラムされた発症の理論を調べるためにCODISマーカーを使用しました。 結果はd18S51-20対立遺伝子を運んだ人とそうでなかった人の間の肺癌の発生、およびd21S11-30.2およびD6S1043-18対立遺伝子を運んだ人とそうでな これらの結果は、個々の癌の素因を予測するために使用されているCODISマーカーを示しているが、ゲノム内の癌関連遺伝子の広範な数があります。
YおよびX STRs
Y染色体には男性の優位性と生殖能力の遺伝子が蓄積されている（Lahn and Page、1997;Graves、2006）ので、男性性に関連する表現型がY STRsに関連している可能性がある。 X連鎖表現型（x染色体上の劣性遺伝子の結果として）は男性でより一般的である（支配的なY染色体ホモログがないため）ので、X STRsとの関連もある可 実際、Ｘ連鎖遺伝子は、最近、マウスにおける雄の生殖能力および子孫の性比に影響を及ぼすことが示されている（Ｋｒｕｇｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2019).
関連性と因果関係
STRと形質または疾患との関連は因果関係を推測しません。
関連性と因果関係
STRの関連性は因果関係を推 さらに、いくつかの対立遺伝子は反対の効果を有するようである：TH01対立遺伝子9.3はストレスを助けるかもしれない（Zhang et al. ら、２ ０ ０ ４）が、自殺との潜在的な関連性も有する（Ｐｅｒｓｓｏｎら、２ ０ ０ ４）。 ら、１ ９ ９ ７；Ｙａｎｇ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2011). 遺伝的変異体は、変異体の存在が、次に疾患を引き起こす効果を生じることが知られている場合に、原因と考えられる（Hu et al., 2018). この研究で報告された関連付けのどれも（トリソミーを除く）因果関係の証拠を提供しない、むしろ彼らは法医学的応用で使用されるいくつかのSTRsと表現型との間の一般的な関係を提案する。 これらの関係は、交絡変数、バイアス、または重要な発見が別の研究によって複製できない場合の偶然によっても説明される可能性があります。 実際、このレビューは、科学におけるより広範ないわゆる「複製危機」を反映していると見ることができます（Schooler、2014）。 このレビューで報告された研究の多くは、多くの比較が偶然に有意である「多重比較問題」に対して十分に緩和されていない可能性がある。 P値のしきい値を0.05に設定することで、有意な結果の5％が偶然に有意であるというリスクがあります。遺伝子解析によって予測できる形質の多くは、遺伝子と環境要因との間の認識的相互作用の結果である。
遺伝子解析によって予測できる形質の多くは、 このレビューで関連性を考慮する場合、形質に関連するより頻繁に観察される対立遺伝子を有する個体が特定の表現型を発現することを示唆するこ 複雑な病気の開発にかかわる多くの根本的なメカニズムがあり、明らかにする医療情報を露出するためにある法廷STRsの危険が最低である間、特定の対立遺伝子の存在は表現型のための高められた潜在性か危険を示すかもしれません。
分子メカニズム
法医学マーカーが非コード領域内に位置していることは事実ですが、イントロンおよび遺伝子の上流または下流のSTRsが表現型に影響を与える可能性があるという証拠が増えています。 ５’非翻訳領域（ＵＴＲ）におけるＳＴＲ変異は、おそらくそれらがタンパク質結合部位として機能するため、遺伝子発現を改変することが知られている（Ｌｉ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2004). ３’ＵＴＲにおける突然変異は、細胞に対して毒性であり得る伸長ｍ ＲＮＡを生じる（Ｌｉ ｅ ｔ ａ ｌ． 2004年、La Spada and Taylor、2010年）。 イントロンには13個のCODIS Strがある（補足表2）。 イントロンにおける突然変異は、遺伝子サイレンシングまたは機能の喪失をもたらし得るｍＲＮＡスプライシングに影響を及ぼすことができる（Li et al. 2004年、La Spada and Taylor、2010年）。 ＴＨ０ １の最初のイントロンにおけるＴＣＡＴ反復は、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの転写調節要素として作用する（Ｍｅｌｏｎｉ ｅ ｔ ａ ｌ．, 1998). アルバネーゼ他 (2001)は、TCATリピート数が三から八まで変化したときのTHの転写活性の低下を報告した。 ＳＴＲは、プロモーター領域においても高密度で見出され、いくつかは、調節要素の間隔を調節することによって遺伝子発現に関与する可能性が高い（Ｇｅｍａｙｅｌ ｅ ｔ ａ ｌ．, 2012; 沢谷他 ら、２ ０ １ ３；Ｇｙｍｒｅｋら、２ ０ １ ４；Ｇｙｍｒｅｋら、 ら、２ ０ １ ６；Ｑｕｉｌｅｚら、２ ０ １ ７；Ｄ．、2016;Gymrek、2017）。
イントロンまたは遺伝子の上流または下流に位置する場合、遺伝子発現のための非常にもっともらしくエピジェネティックな調節因子であるという点で、疾患の原因物質としてのSTRsの病因学的支持が現在ある。 これは、以前に議論された「多重比較問題」に対抗する、Ｋｉｄｄ（１ ９ ９ ３）によって説明されるように、関連性の仮説に対する以前の支持を増加させ、したがって必要な有意水準を減少させることができる。
結論
この研究の結果は、法医学的STRsに関連する表現型形質の多数を示していたが、いずれも独立して原因または疾患の予測であることが それにもかかわらず、病気に関係しているテトラヌクレオチドリピートの多数の報告された例があり、分子メカニズムが示されているので、この推論が近い将来に変わるかもしれないという強いチャンスが残っています。 この研究の1つの制限は、UCSCゲノムブラウザの唯一の使用でした。 今後の研究は、より広い範囲のリソースを使用し、隣接領域、mtDNAおよびY-STRsにおけるSnpなどの追加のマーカーを調査することから利益を得ることができる。 統計的に有意な関連、因果関係、または予測的な関係が発見された場合、それは必ずしもSTRパネルからの除去のための有効な原因ではありませんが、遺伝的プライバシーを取り巻く法律を強化するなどの追加の保護措置は、この情報の乱用を防ぐために考慮する必要があるかもしれません。
著者の貢献
NWは研究を設計し、文献レビューを行い、原稿を書いた。 MBはプロジェクトを考案し、研究を設計し、原稿を見直し、編集しました。 DMはプロジェクトを考案し、管理し、研究を設計し、原稿を見直し、編集しました。 すべての著者は記事に貢献し、提出されたバージョンを承認しました。
利益相反
著者らは、この研究は、潜在的な利益相反と解釈される可能性のある商業的または財政的関係がない場合に行われたと宣言し
補足資料
この記事の補足資料は、オンラインで見つけることができます：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00884/full#supplementary-material
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