Homológia alapja összehasonlító tanulmányokat, a biológia minden szinten a gének fenotípus. A homológia hasonlóság a közös származás és származás miatt, a homoplázia hasonlóság a független evolúció útján. Tekintettel azonban arra, hogy az életnek csak egy fája van, minden organizmus, ezért az organizmusok minden jellemzője, bizonyos fokú kapcsolatot és hasonlóságot mutat egymással. Ez a megosztás lehet a szerkezet hasonlósága vagy akár azonossága, valamint a legutóbbi közös ősök megosztása-mint az emberek és majmok karjainak homológiája-, vagy tükrözhet néhány (gyakran kicsi) hasonlóságot, például a rovarok szárnyai és a madarak szárnyai közötti hasonlóságot, olyan csoportokat, amelyek közös őse mélyen a Metazoa evolúciós történetében rejlik. Tükrözheti a teljes fejlődési utak megosztását, részleges megosztást vagy eltérő útvonalakat. Ez a felülvizsgálat összehasonlítja a homológ besorolású jellemzőket a homoplasztikus osztályokkal, az utóbbi konvergencia, párhuzamosság, visszafordítások, rudiments, csökevények, atavisms. Egyrészt a fejlődési mechanizmusok megmaradhatnak, még akkor is, ha egy teljes szerkezet nem alakul ki (rudiments, vestiges), vagy ha egy struktúra csak egyes egyénekben jelenik meg (atavisms). Másrészt a különböző fejlődési mechanizmusok hasonló (homológ) jellemzőket eredményezhetnek. Közös vizsgálata közeledtét kapcsolat foka közös fejlesztési kiderül, egy kontinuumon belül kiterjesztett kategória homológia, kiterjesztve homológia –> feloldására –> alapjait –> maradványait –> atavisms –> párhuzamosság, a konvergencia, mint az egyetlen osztály homoplasy, egy ötlet, hogy kiderült, hogy meglepően régi. Ez az átállás a homológia és a homoplázia filogenetikai és fejlődési megközelítéseinek áthidalására szolgál, egy híd, amely az evolúciós fejlődésbiológia (evo-devo) kulcsfontosságú pillérét biztosítja. Nem fogja, és gyakorlati értelemben nem tudja megváltoztatni, hogy a filogenetikai elemzésekben hogyan azonosítják a homoplasztikus jellemzőket. De látva alapjait, feloldására, emlékeket, atavisms, valamint a párhuzamosság, mint közelebb homológia, mint homoplasy kellene vezessen bennünket felé keresi a közös elemek mögöttes megalakult a fenotípus (amit egyesek nevezik a mély homológia genetikai és/vagy celluláris mechanizmusok), ahelyett, hogy tárgyalt funkciók tekintetében megosztott vagy független evolúció.