Bevezető

Rövid tandem ismétlődések (STRs) rövid ismétlődő szekvenciák a DNS (2-6 bp), hogy figyelembe körülbelül 3% – a az emberi genom (Lander et al., 2001). Az ismétlődő egységek száma rendkívül változó az egyének körében, amely azonosítási célokra elemezve nagy diszkriminációs képességet kínál. Széles körben elfogadott elképzelés, hogy az STRs nem kódoló jellegű, ezért nem kapcsolódik a génexpresszióhoz (tautz and Schlotterer, 1994; Ramel, 1997; Butler, 2006; Biscotti et al., 2015). Egyre több bizonyíték van azonban arra, hogy a nem kódoló DNS-szekvenciák, például az STRs különböző mechanizmusokon keresztül részt vehetnek a génszabályozásban, ezért fenotípushoz társulnak (Sawaya et al., 2013; Chen et al., 2016).

az első Str markerek használt törvényszéki casework választották 1994—ben a Forensic Science Service (FSS) az Egyesült Királyságban a quadruplex amplifikációs rendszer, amely négy tetranucleotide STRs-TH01, vWA, FES/FPS, és F13A1 (Kimpton et al., 1994). Ezeket a jelölőket egyszerű ismétlési szekvenciáik és a négy bázistól eltérő, rendszeresen elhelyezett allélok megjelenítésére való hajlandóságuk miatt alkalmasnak ítélték PCR-erősítésre; a quadruplex rendszer azonban nem kínált magas szintű megkülönböztetést. 1997-ben a Szövetségi Nyomozó Iroda (FBI) 13 autoszomális STR loci-t jelölt ki a kombinált DNS-Index-rendszer (CODIS) magjának kialakítására, amely a szövetségi, állami és helyi törvényszéki laboratóriumok által készített profilokból áll. Az FSS által eredetileg kiválasztott két markerek (vWA és TH01) a core CODIS készletbe kerültek, míg az Fes/FPS és az F13A01 a polimorfizmus alacsony szintje miatt végül elvetésre került. Az alapkészletet 2010-ben felülvizsgálták, 2017.január 1-jétől további hét STRs-t hajtottak végre. A kereskedelemben kapható DNS-profilkészletek többségét úgy gyártják, hogy tartalmazza az alapvető CODIS STR loci-t (Butler, 2006). Az 1994-es DNS-azonosítási Törvénynek megfelelően a CODIS-t szigorú adatvédelmi protokollok kötik, mivel a tárolt DNS-mintákat és az azt követő elemzéseket szigorúan bűnüldözési azonosítási célokra használják. A 2000-es DNS-elemzési lemaradás megszüntetéséről szóló törvény megerősíti, hogy a törvényszéki alkalmazásokhoz használt markereket kifejezetten azért választották ki, mert nem ismertek semmilyen ismert fizikai tulajdonsággal vagy orvosi jellemzővel.

a CODIS-ra jelölt markereket kifejezetten a genom nem kódoló régióiban való elhelyezkedésük miatt választották ki; azonban azt állítja, hogy a nem kódoló régiók nem játszanak funkcionális szerepet az elmúlt években (Cole, 2007; Kaye, 2007; Sarkar and Adshead, 2010). Egyre több bizonyíték van arra, hogy egyes STR allélok és egészségügyi állapotok (von Wurmb-Schwark et al., 2011; Meraz-Rios et al., 2014). Ez nem tévesztendő össze azokkal a helyzetekkel, amikor az allél vagy a loci diagnosztikus az orvosi állapotokra (pl. triszómia). Ezenkívül lehetséges a biogeográfiai ősök (BGA) kriminalisztikai STRs-ből történő következtetése (Graydon et al., 2009; Algee-Hewitt et al., 2016) a nyomozók segítségével populáció-specifikus STR adatok intelligencia irányítani vizsgálatok (Lowe et al., 2001). BGA korrelál néhány fenotípusok, mint a kék szem színe Az európaiak (Gettings et al., 2014) és világosabb bőrszín az egyenlítőtől való távolság növekedésével (Relethford, 1997). Az STR genotípus önmagában azonban semmilyen közvetlen értelemben nem okozza a BGA fenotípusát, és a genetikai sodródás következtében többnyire a BGA-val társul (mivel a törvényszéki felhasználásra szánt STRs-t úgy választották ki, hogy Hardy Weinberg egyensúlyát mutathassa). Abban az esetben, ha a jövőben minden CODIS markerről kiderül, hogy orvosi állapothoz vagy fizikai tulajdonsághoz kapcsolódik, a DNS-minta elemzését továbbra is csak azonosítási célokra szabad felhasználni az 1994-es DNS-azonosítási törvény alapján.

Katsanis and Wagner (2013) 24 CODIS loci-t értékelt fenotípusos társulások esetében, de nem talált bizonyítékot arra, hogy alátámasztaná az orvosbiológiai szempontból releváns információk nyilvánosságra hozatalát. Például, annak ellenére, hogy a locus TH01 társult több mint 18 tulajdonságok: az alkoholizmus, hogy spinocerebellar ataxia, a szerzők állítják, hogy egyesület ezek a tulajdonságok nem feltétlenül jelenti azt, hogy az egyes genotípusok vagy műveltető vagy a prediktív egy adott tulajdonság. Ezt követően a DNS-elemzési módszerek tudományos Munkacsoportja (2013) által kiadott nyilatkozat megerősítette, hogy bár a jövőben alternatív felfedezések történhetnek, a jelenlegi megértés az, hogy a CODIS loci nem tárnak fel személyazonosságon kívüli információkat. Eddig csak egy STR volt, amelyet az emberi identitás tesztelésében használt jelölőként (Hibor et al., 2005). Az STR locus HumARA az X-kromoszóma kódoló régiójában található, és az izomdisztrófiához kapcsolódik. A HumARA egy trinukleotid-ismétlés, amelyről ismert, hogy hajlamosabb a betegséget okozó terjeszkedésre, mint a tetranukleotid-ismétlés (Orr and Zoghbi, 2007; Castel et al., 2010; Hannan, 2018).

anyagok és módszerek

2018 augusztusa és decembere között három adatbázison (Web of Science, PubMed, and Google Scholar) végezték el a szakirodalom szisztematikus kutatását. Populációs adatok, allélfrekvencia-vizsgálatok, validációs vizsgálatok, technikafejlesztések, egyszeri esetjelentések, mutációs elemzések, off-ladder allélazonosítás, heterozigozitás-vizsgálatok elvesztése és locus jellemzések kizárták. További papírok találhatók vissza hivatkozva releváns vagy hasonló tanulmányok. Az irodalomkutatást követően minden STR-t a kaliforniai Santa Cruz Egyetem (UCSC) Genomböngészőjében (Human GRCh38/hg38 Assembly) elemeztünk a következő számokkal: leképezés és szekvenálás-Base Position-sűrű; STS markerek-teljes, gén és gén előrejelzés—gencode v29-teljes; NCBI RefSeq-pack, fenotípus és Irodalom—OMIM Alleles-teljes; OMIM Pheno Loci-teljes; OMIM gének-teljes; HGMD változatok-teljes; GWAS katalógus-teljes, szabályozás—kódolás Szabályozás-show; RefSeq Func Elems-teljes, variáció—közös SNP(151)-teljes; FlaggedSNPs(151)-teljes, ismétlés—Microsatellite-teljes; egyszerű ismétlés-teljes. A STRs vizsgált tartalmazza a 20 RENDSZERBEN core loci által használt, az FBI, három extra loci jelenleg használt Ausztráliában (Penta-E, Penta D, D6S1043), valamint SE33 amely központi STR a német nemzeti adatbázist, majd ezt követően került beépítésre több Európai készletek.

Eredmények, Megbeszélés

összesen 57 egyesület tanulmányok származik három adatbázisok találkozott a beválasztási kritériumok: a bejelentett link között STR-inclusive gén-egy fenotípus, valamint a statisztikai elemzés beszámolási egy p-érték kisebb, mint 0,05. Ötven egyedi vonást azonosítottak a 24 jelölőn (1.Kiegészítő táblázat). A skizofrénia volt a leggyakrabban leírt tulajdonság, összesen 11 vizsgálatban, amelyek 14 különböző polimorfizmusról számoltak be, amelyek potenciálisan nyolc loci-val társultak. Két külön cikk vizsgálta az allél gyakoriságát az öngyilkosságot megkísérlők körében, és szignifikánsan nagyobb gyakoriságot jelentett a hét kriminalisztikai Loki 10 különböző allélja között. Az intronic STR TH01 volt a legtöbb tanulmány 26 jelentések leíró 27 tulajdonságok potenciálisan kapcsolódik 40 különböző genotípusok. E vizsgálatok közül öt a skizofréniával való összefüggést vizsgálta, öt polimorfizmust jelentett, amelyek valószínűleg összefüggenek a betegséggel. A Penta E, Penta D, D3s1358, SE33 vagy D10S1248 esetében nem találtak allélokat vagy genotípusokat fenotípussal társító vizsgálatokat; azonban egy tanulmány Shi et al. (2012) a Down-szindróma diagnosztizálásának módját a Penta d locus Triszómiájának tesztelésével vizsgálták, mivel a 21.kromoszómán található. Hasonlóképpen, a D21s11-hez mellékelt 10 cikk közül hat vizsgálta a marker hatékonyságát a Down-szindróma genetikai tesztjeiben.

a törvényszéki STR és a fenotípus közötti összefüggést javasló 57 cikk közül egyik sem igazolta, hogy egy adott genotípus kizárólag egy fenotípus okozója lenne. Annak ellenére, hogy a STRs 13 funkcionális génben található, az online Mendelian öröklés az emberben (OMIM) adatbázisban nem volt bejegyzés, amely e gének bármely Str-inclusive régióját tartalmazná betegséggel. A kiemelkedő eredmény a th01 locus polimorfizmusokkal rendelkező fenotípus közötti összefüggést jelentő vizsgálatok száma.

TH01

TH01 a tirozin-hidroxiláz (TH) gén első intronjában található, és általánosan jellemző az n ismétlődő motívum, vagy pedig az n motívum, a GenBank felső szál nómenklatúrája szerint. A katekolaminok dopamin, epinefrin és norepinefrin bioszintézisében részt vevő sebességkorlátozó enzim. A katekolaminok mind neurotranszmitterekként, mind hormonokként működnek, amelyek segítik a homeosztázis fenntartását (Eisenhofer et al., 2004). Mint ilyen, erős kapcsolatról számoltak be a szakirodalomban (Eisenhofer et al., 2004; Ng et al., 2015) A TH expressziójának variációi és a neurológiai, pszichiátriai és szív-és érrendszeri betegségek kialakulása között.

korábbi tanulmányok (McEwen, 2002; Antoni et al., 2006; Bastos et al., 2018) kimutatták, hogy az epinefrin és a norepinefrin megnövekedett szintje akut vagy krónikus stresszben szenvedő egyénekben fejeződik ki. Wei et al. (1997) megállapította, hogy a TH01-9 allélt hordozó egyének a szérum norepinefrin legmagasabb szintjét mutatták a független egészséges felnőttek körében, míg a TH01-7 allél hordozói a legalacsonyabbak. Barbeau et al. (2003) a nyugalmi állapotban lévő és az alkalmazott stresszorok hatására alkalmazott TH01 ismétlések és hemodinamikai paraméterek száma közötti összefüggést vizsgálták. A vizsgálat eredményei azt mutatják, hogy a 6 és 9, 3 TH01 allél a stresszre adott hemodinamikai válaszok csökkenésével jár, ami védő hatást biztosít az allélokat hordozó egyének számára. A TH01-6 allél hordozói alacsonyabb pulzusszám-reaktivitást mutattak, ha növekvő korú stresszoroknak vannak kitéve, mint a TH01-6 allél nélküliek. Továbbá, az egyének hordozó TH01-9.3 a stressz hatására a szisztolés vérnyomás nem emelkedett, míg azok, akik nem rendelkeznek a TH01-9.3 alléltal, a szisztolés vérnyomás reaktivitásának szignifikáns növekedését mutatták az életkor növekedésével. Ezzel szemben a TH01-7 allélról megállapították, hogy káros a vérnyomásra azoknál, akiknek nagyobb testtömeg-indexe (BMI) van. Tantárgyak szállító TH01-7 megjelenik egy magasabb, pihen a szisztolés vérnyomás, mint a BMI növekedésével, illetve a megnövekedett pulzusszám reaktivitás a válasz, hogy a stressz, a növekvő BMI.

TH01-7 szignifikánsan gyakoribb volt a depresszióra hajlamos betegeknél is (Chiba et al., 2000). A TH01-8 allélt gyakrabban találták öngyilkossági kísérletekben (Persson et al., 1997), depressziós egyének (Serretti et al., 1998), és a téveszmés betegségben szenvedők (Morimoto et al., 2002). Persson et al. (2000) megvizsgálta a th01 ismétlések számának 30 személyiségméretre gyakorolt hatását. A TH01-8 alléltal rendelkező alanyok magasabb pontszámot értek el a neuroticizmus aspektusaiban, jelentős különbségek figyelhetők meg a haragot, ellenségességet és sebezhetőséget mutató egyének között (Persson et al., 2000), összehasonlítva a nem TH01-8 allél hordozókkal. Kilenc ismétlés a TH01 locus kapcsolatban voltak téveszmés zavar (Morimoto et al., 2002) és az extraverzió (Tochigi et al., 2006). Továbbá, Yang et al. (2011) végzett számos asszociációs vizsgálatok Kínában, és beszámolt arról, hogy a gyakorisága TH01-9.Az 3 magasabb volt az öngyilkossági viselkedést mutató személyeknél, a TH01-10 pedig jelentősen felülreprezentált volt az erőszakos viselkedést mutató egyéneknél, beleértve a szexuális támadásokat is (Yang et al., 2010) és a férfiak impulzív erőszakos viselkedés (Yang et al., 2013). TH01 is kapcsolódik a különböző betegségek, mint például a skizofrénia (Jacewicz et al., 2006b), hajlam a maláriára (Gaikwad et al., 2005; Alam et al., 2011), hirtelen csecsemőhalál szindróma (SIDS) (Klintschar et al., 2008; Courts and Madea, 2011) és Parkinson-kór (Sutherland et al., 2008).

amint azt korábban említettük, a tirozin levodopává (L-DOPA) történő átalakulását katalizálja, amelyet ezután dopaminná alakítanak át. A dopamin tovább alakítható norepinefrinné és epinefrinné. Az In vitro kísérletek korábban kimutatták, hogy a TH01 képes szabályozni a th gén transzkripciót, kvantitatív hangtompító hatást mutatva (Albanèse et al., 2001). A TH01 allélok az ismétlések számával arányosan gátolták a transzkripciót. Tekintettel arra, hogy oly sok létfontosságú funkciók támaszkodnak a dopamin és metabolitjai (Wei et al., 1997; Meiser et al., 2013), a dopaminerg utak működési zavarai számos pszichológiai betegség kialakulásához társultak (Meiser et al., 2013), Ebben a felülvizsgálatban a TH01 nagyrészt a skizofréniához kapcsolódott (Kurumaji et al., 2001) és a Parkinson-kór (Meiser et al., 2013). A hosszabb TH01-9.3 pedig TH01-10 allélek, megjósolta, hogy a hozam kevesebb dopamin, találtak gyakrabban személyek megjelenítése tulajdonságok jelzi, hogy a dopaminerg zavar, mint impulzív erőszakos viselkedés (Yang et al., 2013), szexuális zaklatás (Yang et al., 2010) és a függőség (Sander et al., 1998; Anney et al., 2004).

néhány ellentmondó összefüggést figyeltek meg a TH01 és bizonyos fenotípusok között. Például de Benedictis et al. (1998) jelentett jelentős társulása >9 TH01 megismétli a hosszú élettartam a férfi olasz centenáriumok. Contrariwise, von Wurmb-Schwark et al. (2011) nem tudták megismételni ezt az eredményt, ha ugyanazt a vizsgálati tervet használják egy német populációra, csakúgy, mint Bediaga et al. (2015) szintén nem tudták megerősíteni egy észak-spanyol népességű társulást. Hasonlóképpen ellentmondásos jelentések vannak a TH01-9 társulásáról.3 a SIDS-szel az Európai populációkban. 2008-ban Klintschar et al. (2008) megállapította, hogy a th01-9,3 allél gyakorisága szignifikánsan magasabb volt a SIDS-ben szenvedő betegeknél, mint egy német populációban. Ezt a szövetséget a bíróságok és a Madea is megerősítette (2011). Éppen ellenkezőleg, Studer et al. (2014) nem tudták megismételni ezt az eredményt a svájci lakosság. További populációalapú asszociációs vizsgálatokra van szükség a TH01 és ezen fenotípusok közötti asszociációk létezésének megerősítéséhez.

a TH01-et vizsgáló vizsgálatok egyike sem állapította meg, hogy a kapcsolódó genotípusok okozták a betegséget; ezért az említett társulások csak lehetségesnek vagy potenciálisnak tekinthetők. A TH01 – hez kapcsolódó számos tulajdonság multifaktoriális, ami azt jelenti, hogy mind a gének, mind a környezet befolyásolja őket, például a Parkinson-kór esetében (Meiser et al., 2013) és skizofrénia (Zhuo et al., 2019).

más STR markerek potenciális társulásai

a skizofrénia egy összetett öröklődő mentális egészségügyi rendellenesség, amelyet téveszmék, hallucinációk és csökkent társadalmi megismerés jellemez. Magától értetődik, hogy a skizofrénia poligén, a betegséget terhelő allélok elosztása több loci (Giusti-Rodríguez and Sullivan, 2013; Zhuo et al., 2019). Ennek a fogalomnak megfelelően tanulmányunk kimutatta, hogy a skizofrénia a legnagyobb számú STRs-vel társult: FGA, TH01, vWA, D2S441, D2S1338, D8S1179, D16S539 és D18S51. Egy tanulmány (Jacewicz et al., 2006a) megállapította, hogy a d18s51-ben és a D2S1338-ban a hosszabb ismétlődések szignifikánsan gyakoribbak voltak a betegeknél, mint a kontroll-csoportban. Ez a tendencia összhangban van a trinukleotid ismétlések kiterjedésével más súlyos pszichiátriai rendellenességekben. Bár a betegség velejárója kihívást jelentett a kutatók számára, a neurotranszmitter rendellenességeket már régóta elismerték a skizofrénia patogenezisének egyik fő tényezőjeként (Mäki et al., 2005; Modai és Shomron, 2016).

a genetikai mutációk önmagukban nem elegendőek a skizofrénia kialakulásának és kialakulásának kiváltásához; ezért további kutatásokra van szükség annak feltárásához, hogy a genetikai kockázati tényezők hogyan hatnak a környezeti kockázati tényezőkre az állapot kialakulásában, kialakulásában és progressziójában.

a vénás thromboembolia (VTE) a mélyvénás trombózis és/vagy tüdőembólia előfordulása által meghatározott rendellenesség. vWF egy glikoprotein, amely szerepet játszik a thrombocyta adhézió során véralvadási; ezért érthető, hogy a változtatások a szérum vWF hozzájárulhat a trombózis betegségek (Laird et al., 2007). Meraz-Rios et al. (2014) megállapította, hogy a VWA-18, a himlő-9 és a himlő-12 gyakrabban fordult elő vénás trombózisban szenvedő egyéneknél a Mexikói mestizo populációban. Ezenkívül a VWA és a himlő krónikus myeloid leukémiával (Wang et al., 2012).

Trisomys

Down-szindróma vagy Trisomy-21, diagnosztizálható egy harmadik allél jelenlétével a 21. kromoszómán. Ez a triszómia jelen lehet a 21. kromoszómán található bármely polimorf markerben, és számos tanulmány értékeli a D21s11 és a Penta D alkalmazását a Down-szindróma detektálásában hatékony markerként (Yoon et al., 2002; Liou et al., 2004; Shi et al., 2012; Guan et al., 2013). Hasonlóképpen, a d18s51 és a D13S317 genetikai markerként is használható az Edwards-szindróma (Trisomy-18) és a Patau-szindróma (Trisomy-13) jelenlétének diagnosztizálására. A Trisomys egy ok-okozati összefüggés példája, mivel minden három kromoszómával rendelkező személy érintett lesz. Míg a 13, 18 vagy 21 kromoszómán lévő extra allél jelenléte nem tárja fel a donor számára ismeretlen egészségügyi állapotot, további azonosítható információkat nyújt a nyomozók számára.

rák

a kriminalisztikai STRs-t több vizsgálatban genetikai markerként használták a rákkal kapcsolatos allélok szűrésére. Hui et al. (2014) megállapította, hogy két pár allél (d8s1179-16 a D5S818-13 és D2S1338-23 a D6S1043-11) találtak gyakrabban gyomorrákos betegek. Ezenkívül egy kínai tanulmány jelentős összefüggést állapított meg a d6s1043 homozigóta alléljai és az invazív méhnyakrák fokozott kockázata között (Wu et al., 2008). A heterozigóta (LOH) elvesztése olyan genetikai mutáció, amely egy heterozigóta gén egy példányának elvesztését eredményezi, ami gyakran rákot eredményez a funkcionális tumorszuppresszor gének elvesztése miatt. LOH különböző rákos szövetekben figyeltek meg számos törvényszéki loci, mint a CSF1PO, FGA, vWA, D3S1358, D5S818, D8S1179, D13S317, és D18S51 betegek gége rák (Rogowski et al., 2004). A LOH megváltoztathatja a DNS-profil eredményeit, és figyelembe kell venni azokat az eseteket, amikor csak rákos szövet áll rendelkezésre elemzésre (Peloso et al., 2003; Zhou et al., 2017).

Qi et al. (2018) tanulmányt végzett annak lehetőségéről, hogy a genetikai markerek helyett a kapcsolódó géneket használják a tüdő-és májrákra való hajlam szűrésére. Ez a tanulmány CODIS markereket használt a programozott megjelenés elméletének vizsgálatára, amely feltételezi, hogy egy krónikus betegség előfordulása független az életkortól, ehelyett a programozott megjelenési mintától függhet. Az eredmények szignifikáns különbséget mutattak a tüdőrák előfordulásában azok között, akik a D18S51-20 allélt hordozták, és azok között, akik nem, valamint a májrák előfordulási gyakorisága a d21s11-30.2 és D6S1043-18 allél és azok között, akik nem. Míg ezek az eredmények azt mutatják, hogy a CODIS markereket az egyén rákra való hajlamának előrejelzésére használják, a genomban számos rákhoz kapcsolódó gén található; ezért a genetikai Adatvédelem megsértésének kockázata ezen információkkal továbbra is alacsony.

Y és X STRs

az Y kromoszóma férfi előny-és termékenységi géneket halmozott fel (Lahn and Page, 1997; Graves, 2006), így lehetséges, hogy a malenesshez kapcsolódó fenotípusok az Y STRs-hez kapcsolódnak. Az X-kapcsolt fenotípusok (az X kromoszómán található recesszív gének eredményeként) a férfiaknál gyakoribbak (mivel nincs domináns Y kromoszóma homolog), így az X STRs-szel is társulhatnak. Valójában az X-hez kapcsolt gének a közelmúltban kimutatták, hogy befolyásolják a hímek termékenységét és az utódok nemi arányát egerekben (Kruger et al., 2019).

társulás Versus Causation

az STR egy tulajdonsággal vagy betegséggel való társulása nem okoz ok-okozati összefüggést. Sőt, egyes allélok úgy tűnik, hogy ellentétes hatások: TH01 allél 9.3 segíthet a stressz (Zhang et al., 2004), de potenciális kapcsolatban áll az öngyilkossággal (Persson et al., 1997; Yang et al., 2011). A genetikai variáns akkor tekinthető okozatosnak, ha ismert, hogy a változat jelenléte olyan hatást eredményez, amely viszont betegséget okoz (Hu et al., 2018). Az ebben a tanulmányban bejelentett egyesületek egyike sem nyújt bizonyítékot az ok-okozati összefüggésre (kivéve a trisomys-t), inkább általános kapcsolatot javasolnak a törvényszéki alkalmazásokban használt STRs-ek és a fenotípus között. Ezeket a kapcsolatokat zavaró változókkal is meg lehet magyarázni, elfogultság, vagy véletlenül olyan esetekben, amikor egy jelentős megállapítást egy másik tanulmány nem képes megismételni. Valójában ez a felülvizsgálat a tudomány szélesebb körű úgynevezett “replikációs válságának” tükröződéseként tekinthető (Schooler, 2014). Az ebben a felülvizsgálatban bejelentett tanulmányok közül sok nem enyhült eléggé a “többszörös összehasonlító probléma” ellen, ahol számos összehasonlítás véletlenszerűen jelentős lesz. A p-érték küszöbérték 0,05-re történő beállításával fennáll annak a veszélye, hogy a jelentős eredmények 5% – a véletlenszerűen jelentős.

a genetikai elemzéssel megjósolható tulajdonságok közül sok a gének és a környezeti tényezők közötti episztatikus kölcsönhatások eredménye. Ha figyelembe vesszük az egyesületek ebben a felülvizsgálatban, nem ésszerű azt sugallják, hogy az egyén rendelkezik a gyakrabban megfigyelt allél társított tulajdonság kifejezi egy adott fenotípus. Számos mögöttes mechanizmus vesz részt a komplex betegségek kialakulásában, és bár a kriminalisztikai STRs kockázata, hogy felfedje az orvosi információkat, minimális, egy adott allél jelenléte fokozott potenciált vagy kockázatot jelenthet a fenotípusra.

molekuláris mechanizmusok

bár továbbra is igaz, hogy a kriminalisztikai markerek nem kódoló régiókban találhatók, egyre több bizonyíték van arra, hogy az STRs intronokban és a gének felfelé vagy lefelé áramlása befolyásolhatja a fenotípust. STR mutációk az 5 ” LE nem fordított régió (UTR) ismert, hogy módosítsa a génexpresszió, valószínűleg azért, mert szolgálnak fehérje kötőhelyek (Li et al., 2004). A 3′ UTR mutációi kiterjesztett mRNS-t eredményeznek, amely mérgező lehet a sejtre (Li et al., 2004; La Spada és Taylor, 2010). Az intronokban 13 CODIS STRs található (2.Kiegészítő táblázat). Az intronok mutációi befolyásolhatják az mRNS-splicing-et, ami gén-hangtompítást vagy funkcióvesztést okozhat (Li et al., 2004; La Spada és Taylor, 2010). A TCAT ismétlése a TH01 első intronjában in vitro transzkripciós szabályozó elemként működik (Meloni et al., 1998). Albanèse et al. (2001) A TH transzkripciós aktivitásának csökkenését jelentette, mivel a TCAT ismétlési száma háromról nyolcra változott. STRs is megtalálható a nagy sűrűségű promoter régiókban, és nagyon valószínű, hogy néhány érintett gén expresszió modulálásával távolság szabályozó elemek (Gemayel et al., 2012; Sawaya et al., 2013; Gymrek et al., 2016; Quilez et al., 2016; Gymrek, 2017).

most etiológiai támogatása STRs, mint a kórokozók a betegség, hogy egészen valószínűsíthetőleg epigenetikus szabályozó gén kifejeződése, amikor található intronok, vagy a fel – vagy lefelé-patak gének. Ez növelheti a társulási hipotézisek előzetes támogatását, ezáltal csökkentheti a szükséges szignifikancia szintet, amint azt a Kidd (1993) írja le, amely ellentétes a korábban tárgyalt “többszörös összehasonlító problémával”.

Következtetés

Amíg a vizsgálat eredményei utalnak nagyszámú fenotípusos tulajdonságok kapcsolódó törvényszéki STRs, nem találtak függetlenül kiváltó vagy a prediktív betegség. Mindazonáltal, mivel számos olyan esetet jelentettek, amikor a tetranukleotid ismétlődik a betegségben, és molekuláris mechanizmusokat mutattak ki, továbbra is nagy az esély arra, hogy ez a következtetés megváltozhat a közeljövőben. A tanulmány egyik korlátozása az UCSC Genom böngésző kizárólagos használata volt. A jövőbeli tanulmányok számára előnyös lehet a források szélesebb körének alkalmazása, valamint további markerek, például SNP-k vizsgálata a kísérő régiókban, az mtDNA-ban és az Y-STRs-ben. Abban az esetben, ha statisztikailag szignifikáns összefüggést, ok-okozati vagy prediktív összefüggést fedeznek fel, ez nem feltétlenül érvényes ok az STR panelekből való eltávolításra, de további védelmi intézkedéseket, például a genetikai adatvédelmet körülvevő jogszabályok szigorítását figyelembe kell venni ezen információk visszaélésének megelőzése érdekében.

szerző

NW megtervezte a tanulmányt, elvégezte a szakirodalmi felülvizsgálatot, és megírta a kéziratot. MB megtervezte a projektet, megtervezte a tanulmányt, áttekintette és szerkesztette a kéziratot. A DM kidolgozta és irányította a projektet, megtervezte a tanulmányt, áttekintette és szerkesztette a kéziratot. Minden szerző hozzájárult a cikkhez, és jóváhagyta a benyújtott verziót.

összeférhetetlenség

a szerzők kijelentik, hogy a kutatást olyan kereskedelmi vagy pénzügyi kapcsolatok hiányában végezték, amelyek potenciális összeférhetetlenségnek tekinthetők.

Kiegészítő anyag

A cikk kiegészítő anyaga megtalálható online:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00884/full#supplementary-material