L’histoire de l’administration de Karachi commence en 1846, lorsqu’une épidémie de choléra menace les 9 000 habitants de la ville. Les efforts de lutte contre cette maladie infectieuse ont été coordonnés par un Conseil de conservation. En 1852, le Conseil de conservation est devenu une Commission municipale et en 1853, il a été transformé en Comité municipal. En 1878, la ville a été habilitée à percevoir des impôts au niveau local.

La Loi municipale sur la Ville de Karachi a été promulguée en 1933 et le Comité municipal est devenu une Corporation municipale multiethnique de 57 membres avec un Président et un Vice-Président à la place de l’ancien maire et du Maire adjoint. Le premier président était Jamshed Naserwanji, qui avait déjà été maire pendant vingt ans.

Après l’indépendance en 1947, Karachi est devenue la capitale de l’État nouvellement indépendant du Pakistan et le maire Hakim Ehsan a reçu le Gouverneur général, Muhammad Ali Jinnah, à l’aéroport international de Karachi. En 1948, les limites de la ville ont été fixées dans le nouveau territoire de la Capitale fédérale, qui couvrait 2 103 km2 mais comprenait également plusieurs petites villes et villages séparés de Karachi.

Au cours de la période 1961-1970, l’ancien Territoire de la Capitale fédérale a été fusionné avec l’État princier voisin de Las Bela pour former la Division Karachi-Bela du Pakistan occidental. Au cours des années 1970, cette fusion a été inversée et Karachi est devenue une division à part entière, couvrant 3 528 km2.

La Corporation Municipale de Karachi a été transformée en Corporation métropolitaine en 1976, suivie par des Comités municipaux de Zone opérant de 1987 à 1994. Le système de gouvernement a changé à nouveau en 1996, lorsque la division de Karachi a été subdivisée en cinq districts, chacun avec sa propre corporation municipale.

En 1999, le président Pervez Musharraf s’est engagé à une refonte de l’ensemble de la structure administrative du pays. En l’an 2000, l’ensemble du troisième niveau de gouvernement (divisions administratives) a été supprimé au profit du quatrième niveau (districts). À Karachi, la division de Karachi et les cinq districts ont été fusionnés pour former une nouvelle Ville-District qui a été subdivisée en août 2001 en dix-huit villes autonomes comprenant 178 conseils syndicaux locaux.

Le système urbain a été aboli en 2011 et l’Autorité de développement de Karachi est gérée au niveau provincial plutôt qu’au niveau local.