Valomikroskoopit

useimmissa yhdistemikroskoopeissa on nykyään valaisin, joka on rakennettu pohjaan. Lavan alapuolella sijaitsevassa lauhduttimessa on linssit, jotka kohdistavat valon näytteeseen, ja kalvo, joka säätelee kontrastia. Kun valo on kulkenut näyttämöllä olevan näytteen läpi, se siirtyy objektiivilinssiin. Useimmissa valomikroskoopeissa on kolme tai neljä objektiivia pyörivässä tykkitornissa. Nämä linssit suurentavat kuvaa 4x-100x. Tämän jälkeen valo siirtyy kehoputkea pitkin silmälinssiin, joka suurentaa kuvaa vielä 10-15x. Tutkimusmikroskoopeissa ja paremmissa opiskelijamikroskoopeissa on pari silmälinssiä, jotta näytettä voidaan tarkastella molemmilla silmillä yhtä aikaa.

on olemassa monia muunnoksia erikoiskäyttöön tarkoitetuista valomikroskoopeista. Nestemäisen väliaineen peittämien kudosviljelmien tarkasteluun biologit voivat käyttää käänteistä valomikroskooppia, jossa viljelmä valaistaan ylhäältä ja objektiivit asetetaan näytteen alapuolelle. Faasikontrastimikroskoopilla voidaan parantaa kontrastia elävissä näytteissä, jolloin vältetään tappavien fiksatiivien ja tahrojen käyttö. Polarisoivaa valomikroskooppia käytetään muun muassa kiteiden ja mineraalien analysointiin. Fluoresenssimikroskoopilla tutkitaan rakenteita, jotka sitovat erityisiä fluoresoivia väriaineita. Sitä voidaan käyttää esimerkiksi tunnistamaan, missä värjäytynyt hormoni sitoutuu kohdesoluunsa.

Yhdistelmävalomikroskoopeilla saavutetaan hyödyllisiä suurennoksia jopa 1200x ja resoluutioita noin 0,25 mikrometriin asti. Toisin sanoen kaksi objektia solussa voi olla niinkin lähellä kuin 0.25 mikrometriä ja edelleen havaittu erillisinä kokonaisuuksina. Tällainen resoluutio on tarpeeksi hyvä nähdä useimmat bakteerit ja jotkut mitokondriot ja mikrovillit.

nämä mikroskoopit vaativat yleensä ohuita, läpinäkyviä, suhteellisen pieniä näytteitä. Ne edellyttävät myös, että käyttäjä sopeutuu optisen inversion ilmiöön; jos näytettä siirretään vasemmalle, se näyttää mikroskoopin alla liikkuvan oikealle; kun sitä siirretään ylöspäin, se näyttää liikkuvan alaspäin; ja päinvastoin. Stereomikroskooppi toimii paljon pienemmällä suurennuksella ja resoluutiolla, mutta sillä on useita etuja: (1) siinä on kaksi linssijärjestelmää, jotka tarkastelevat näytettä hieman eri kulmista ja antavat siten näytteelle stereoskooppisen (kolmiulotteisen) ulkonäön; (2) siinä voidaan käyttää joko lähetettyä tai heijastunutta valoa; ja heijastuneen valon avulla voidaan tarkastella läpinäkymättömiä näytteitä, kuten kiviä, fossiileja, hyönteisiä, elektronisia piirilevyjä jne.; (3) sillä on paljon suurempi työskentelyetäisyys näytteen ja objektiivin välillä, mikä mahdollistaa suhteellisen suurten kohteiden tutkimisen ja esineiden helpon käsittelyn mikroskoopilla.; 4) työskentelyetäisyys mahdollistaa sellaisten näytteiden, kuten hyönteisten, suhteellisen helpon leikkaamisen, jolloin kädet ja instrumentit pääsevät työskentelytilaan mikroskoopin läpi katsellessa, ja 5) se ei aiheuta optista inversiota, ts.oikealla olevat liikkeet näyttävät menevän oikealle, mikä tekee leikkaamisen ja muut käsittelyt paljon helpommiksi.

valomikroskopian hyödyllisyyttä säätelee sen käyttämä näkyvä valo, joka rajoittaa erottelukykyä. Mitä lyhyempi valaistuksen aallonpituus, sitä parempi resoluutio. Elektronisäteillä on lyhyemmät aallonpituudet kuin fotoneilla. Elektronimikroskoopin keksiminen 1930-luvun lopulla ja sen tarkentaminen seuraavan puolen vuosisadan aikana mahdollisti huomattavasti paremman solun ja kudoksen hienorakenteen visualisoinnin.