Henry M. Flagler, kokonaan Henry Morrison Flagler, (syntynyt 2.tammikuuta 1830 Hopewell, New York, Yhdysvallat—kuoli 20. toukokuuta 1913 West Palm Beach, Florida), yhdysvaltalainen rahoittaja ja John D. Rockefeller, Sr.: n osakas perustaessaan Standard Oil Companyn. Flagler oli myös uranuurtaja Floridan kehittämisessä Yhdysvaltain lomakohteeksi.

Vuoden 1850 tienoilla Flaglerista tuli viljakauppias Ohion Bellevuessa, jossa hän tutustui Rockefelleriin ja myi tämän kautta viljaa. 50 000 dollarin pääomalla Flagler teki epäonnistuneen yrityksen valmistaa suolaa Michiganissa ja palasi Clevelandiin, jossa hän vuonna 1867 liittyi Rockefellerin kanssa öljy-yhtiöön, josta tuli Standard Oil vuonna 1870. Hän toimi Standard Oil of New Jerseyn johtajana vuoteen 1911 saakka.

vuonna 1883 Flagler vieraili Floridassa ja osti kolme vuotta myöhemmin useita rautateitä, jotka hän yhdisti Florida East Coast Railwayksi. 1890-luvulla hän rakennutti luksushotellien ketjun rautatien varrelle sekä Bahaman saarille Nassauhun. Hän ruoppasi myös Miamin satamaa ja perusti höyrylaivalinjoja Key Westiin ja Nassauhun.