introduktion

korte tandem-gentagelser (STRs) er korte gentagne sekvenser af DNA (2-6 bp), der tegner sig for cirka 3% af det humane genom (Lander et al., 2001). Antallet af gentagelsesenheder er meget variabelt blandt enkeltpersoner, hvilket giver en høj diskriminationskraft, når de analyseres til identifikationsformål. Det er en bredt accepteret opfattelse, at STRs ikke er kodende og derfor ikke er impliceret i genekspression (1994; Ramel, 1997; Butler, 2006; Biscotti et al., 2015). Der er imidlertid stigende beviser for, at ikke-kodende DNA-sekvenser, såsom STRs, kan være involveret i genregulering via forskellige mekanismer og dermed være forbundet med fænotype., 2013; Chen et al., 2016).

de første str—markører, der blev brugt i retsmedicinsk sagsbehandling, blev valgt i 1994 af Forensic Science Service (FSS) i Det Forenede Kongerige til et firedobbelt amplifikationssystem bestående af fire tetranukleotid STRs-TH01, Fes / FPS og F13A1 (Kimpton et al., 1994). Disse markører blev anset for egnede til PCR-amplifikation på grund af deres enkle gentagelsessekvenser og deres tilbøjelighed til at vise regelmæssigt fordelte alleler, der adskiller sig med fire baser; imidlertid, firedoblingssystemet tilbød ikke et højt niveau af diskrimination. I 1997 blev den Federal Bureau of Investigation (FBI) nominerede 13 autosomale STR loci til at danne kernen i det kombinerede DNA-indekssystem (CODIS), en database bestående af profiler bidraget af føderale, statslige og lokale retsmedicinske laboratorier. To af de markører, der oprindeligt blev valgt af FSS (VVA og TH01), blev inkluderet i kernekodissættet, mens FES/FPS og F13A01 til sidst blev kasseret på grund af lave niveauer af polymorfisme. Kernesættet blev gennemgået i 2010 med yderligere syv STRs implementeret fra 1.januar 2017. Størstedelen af kommercielt tilgængelige DNA-profileringssæt er fremstillet til at omfatte core CODIS STR loci (Butler, 2006). I overensstemmelse med DNA Identification Act of 1994 er CODIS bundet af strenge privatlivsbeskyttelsesprotokoller, idet de lagrede DNA-prøver og efterfølgende analyser anvendes strengt til retshåndhævelsesidentifikationsformål. DNA Analysis Backlog Elimination Act of 2000 bekræfter, at markørerne, der blev brugt til retsmedicinske applikationer, blev specifikt valgt, fordi de ikke vides at være forbundet med nogen kendte fysiske træk eller medicinske egenskaber.de markører, der er nomineret til CODIS, blev specifikt valgt på grund af deres placering inden for ikke-kodende regioner i genomet; påstande om, at ikke-kodende regioner ikke spiller nogen funktionel rolle, er imidlertid blevet anfægtet i de senere år (Cole, 2007; Kaye, 2007; Sarkar og Adshead, 2010). Der er stigende beviser for, at der kan være sammenhænge mellem visse STR-alleler og medicinske tilstande (von., 2011; Rios et al., 2014). Dette bør ikke forveksles med situationer, hvor alleler eller loci er diagnostiske for medicinske tilstande (f.eks. Derudover er evnen til at udlede biogeografisk herkomst (BGA) fra retsmedicinsk STRs mulig (Graydon et al., 2009; Algee et al., 2016) med efterforskere, der bruger befolkningsspecifikke STR-data som intelligens til at vejlede forespørgsler., 2001). BGA er korreleret med nogle fænotyper, såsom blå øjenfarve hos europæere (Gettings et al., 2014) og lysere hudfarve med stigende afstand fra ækvator (Relethford, 1997). Imidlertid er STR-genotypen i sig selv ikke årsag til BGA-fænotype i nogen direkte forstand og er for det meste forbundet med BGA som et resultat af genetisk drift (som STRs til retsmedicinsk brug er valgt til at udvise hårdfør ligevægt). I tilfælde af, at CODIS-markører i fremtiden viser sig at være knyttet til en medicinsk tilstand eller fysisk egenskab, skal analysen af DNA-prøven stadig kun bruges til identifikationsformål i henhold til DNA-Identifikationsloven af 1994.(2013) vurderede 24 CODIS loci for fænotypiske foreninger, men fandt ingen beviser til støtte for videregivelse af biomedicinsk relevante oplysninger. For eksempel, på trods af at locus TH01 var forbundet med så mange som 18 træk: fra alkoholisme til spinocerebellar ataksi, siger forfatterne, at tilknytning til disse træk ikke nødvendigvis indebærer, at individuelle genotyper er årsagssammenhængende eller forudsigelige for et bestemt træk. Efter dette gentog en erklæring fra den videnskabelige arbejdsgruppe for DNA-analysemetoder (2013), at selv om der kan foretages alternative opdagelser i fremtiden, er den nuværende forståelse, at CODIS loci ikke afslører nogen information ud over identitet. Der har kun været en STR til dato, der er blevet fjernet fra overvejelse som en markør, der anvendes i human identity testing., 2005). STR locus HumARA er placeret i et kodende område på kromosom og har været forbundet med muskeldystrofi. HumARA er en trinukleotid-gentagelse, og disse er kendt for at være mere tilbøjelige til sygdomsfremkaldende udvidelser end tetranukleotid-gentagelser (Orr og Soghbi, 2007; Castel et al., 2010; Hannan, 2018).

materialer og metoder

en systematisk søgning i litteraturen blev udført på tværs af tre databaser (Videnskabsnettet, PubMed og Google Scholar) mellem August og December 2018. Befolkningsdataundersøgelser, allelfrekvensundersøgelser, valideringsundersøgelser, teknik udvikling, enkelt case rapporter, mutationsanalyser, off-stigen allel identifikation, tab af heterosygositetsundersøgelser og locus karakteriseringer blev udelukket. Yderligere papirer blev placeret ved at henvise til relevante eller lignende undersøgelser. Efter litteratursøgningen blev hver STR analyseret i University of California genom bro. ser (Human GRCh38/hg38 Assembly) ved hjælp af følgende spor: kortlægning og sekventering-basisposition-tæt; STS markører-fuld, gen og Gen forudsigelse-GENCODE v29-fuld; NCBI Refseks-pakke, fænotype og litteratur—omim alleler-fuld; omim Pheno Loci-fuld; omim gener-fuld; HGMD varianter-fuld; GVAR katalog-fuld, regulering—kode regulering-Vis; Refseks Func Elems-fuld, Variation—fælles SNP ‘er(151)-fuld; Flaggedsnp’ er(151)-fuld, gentagelser—mikrosatellit-fuld; enkle gentagelser-fuld. Den undersøgte STRs omfattede de 20 CODIS core loci, der blev brugt af FBI, tre ekstra loci, der i øjeblikket bruges i Australien (Penta E, Penta D, D6S1043) og SE33, som er en kerne STR i den tyske nationale database og efterfølgende er blevet indarbejdet i flere europæiske sæt.

resultater og diskussion

i alt 57 associeringsundersøgelser hentet fra tre databaser opfyldte vores inklusionskriterier: en rapporteret forbindelse mellem et str-inkluderende gen og en fænotype og en statistisk analyse, der rapporterer en p-værdi mindre end 0,05. Halvtreds unikke træk blev identificeret på tværs af de 24 markører (supplerende tabel 1). Schisofreni var det træk, der hyppigst blev beskrevet med i alt 11 undersøgelser, der rapporterede data om 14 forskellige polymorfier, der potentielt var forbundet med otte loci. To separate artikler undersøgte allelfrekvensen blandt mennesker, der forsøgte selvmord og rapporterede en signifikant højere frekvens blandt 10 forskellige alleler af syv retsmedicinske loci. Den introniske STR TH01 havde det største antal undersøgelser med 26 rapporter, der beskriver 27 træk, der potentielt er knyttet til 40 forskellige genotyper. Fem af disse undersøgelser undersøgte et link til schisofreni og rapporterede fem polymorfier, der muligvis er forbundet med sygdommen. Der blev ikke fundet nogen undersøgelser, der associerede alleler eller genotyper med fænotype for Penta E, Penta D, D3S1358, SE33 eller D10S1248; dog en undersøgelse foretaget af Shi et al. (2012) undersøgte metoden til diagnosticering af Nedsyndrom ved at teste for en trisomi ved Penta D locus, da den er placeret på kromosom 21. Tilsvarende undersøgte seks af de 10 artikler, der var inkluderet i D21S11, markørens effektivitet i genetiske tests for nedsat syndrom.

af de 57 artikler, der foreslog en sammenhæng mellem en retsmedicinsk STR og en fænotype, bekræftede ingen af dem, at nogen bestemt genotype udelukkende var årsag til en fænotype. På trods af at 13 af STRs var placeret i et funktionelt gen, var der ingen poster i online Mendelian Arv i mennesket (omim) database vedrørende eventuelle str-inkluderende regioner af disse gener med en sygdom. Et stand-out resultat er antallet af undersøgelser, der rapporterer en sammenhæng mellem en fænotype med polymorfier på TH01 locus.

TH01

TH01 er placeret inden for den første intron af tyrosinhydroksylase (TH) genet og er almindeligvis karakteriseret ved gentagelsesmotivet n eller alternativt af N-motivet ifølge GenBank topstrengnomenklatur. Dette er den hastighedsbegrænsende faktor, der er involveret i biosyntesen af catecholaminerne dopamin, epinephrin og norepinephrin. Catecholaminer fungerer som både neurotransmittere og hormoner, der hjælper med at opretholde homeostase (Eisenhofer et al., 2004). Som sådan er der rapporteret om et stærkt forhold i litteraturen (Eisenhofer et al., 2004; Ng et al., 2015) mellem variationer i udtrykket af TH og udviklingen af neurologiske, psykiatriske og hjerte-kar-sygdomme.

tidligere undersøgelser (Antoni et al., 2006; Bastos et al., 2018) har vist, at øgede niveauer af epinephrin og norepinephrin udtrykkes hos personer, der oplever akut eller kronisk stress. Et al. (1997) fandt ud af, at personer, der bærer TH01-9-allelen, viste de højeste niveauer af serum norepinephrin blandt en population af ikke-relaterede raske voksne, mens bærere af TH01-7-allelen viste det laveste. Barbeau et al. (2003) undersøgte forholdet mellem antallet af th01-gentagelser og hæmodynamiske parametre hos forsøgspersoner i hvile og som reaktion på anvendte stressfaktorer. Resultaterne af denne undersøgelse indikerer, at 6 og 9,3 TH01 alleler er forbundet med et fald i de hæmodynamiske reaktioner på stress, hvilket giver en beskyttende virkning for personer, der bærer disse alleler. Bærere af TH01-6-allelen viste en lavere hjertefrekvensreaktivitet, når de blev udsat for stressfaktorer med stigende alder end dem uden TH01-6-allelen. Desuden personer, der bærer TH01-9.3 viste ingen stigning i systolisk blodtryk som reaktion på stress, mens de, der ikke havde TH01-9,3-allelen, viste en signifikant stigning i systolisk blodtryksreaktivitet med stigende alder. Omvendt viste TH01 – 7-allelen sig at være skadelig for blodtrykket hos dem med et større kropsmasseindeks (BMI). Emner, der bærer TH01 – 7, viste et højere hvilende systolisk blodtryk, da BMI stiger og øget hjertefrekvensreaktivitet som reaktion på stressorer med stigende BMI.

TH01-7 blev også rapporteret at være signifikant mere udbredt hos patienter, der er tilbøjelige til depression (Chiba et al., 2000). TH01 – 8-allelen blev fundet hyppigere hos selvmordsforsøgere (Persson et al., 1997), personer med depression (Serretti et al., 1998), og personer med vrangforestillinger (Morimoto et al., 2002). Persson et al. (2000) undersøgte indflydelsen af antallet af th01-gentagelser på 30 personlighedsdimensioner. Emner, der besidder TH01 – 8-allelen, scorede højere i neurotismens facetter med signifikante forskelle observeret mellem individer, der viser vrede, fjendtlighed og sårbarhed (Persson et al., 2000) sammenlignet med ikke-TH01-8 allelbærere. Ni gentagelser på th01-locus var forbundet med vrangforestillinger (Morimoto et al., 2002) og ekstraversion (Tochigi et al., 2006). Desuden, Yang et al. (2011) gennemført en række associeringsundersøgelser i Kina og rapporterede, at hyppigheden af TH01-9.3 var højere hos dem, der viste selvmordsadfærd, og TH01-10 var signifikant overrepræsenteret hos personer, der demonstrerede voldelig adfærd, herunder seksuelle overgreb (Yang et al., 2010) og hos mænd med impulsiv voldelig opførsel (Yang et al., 2013). TH01 var også forbundet med forskellige sygdomstilstande som f.eks., 2006b), prædisponering for malaria (Gaikvad et al., 2005; Alam et al., 2011), sudden infant Death syndrome (SIDS) (Klintschar et al., 2008; Courts and Madea, 2011) og Parkinsons sygdom (Sutherland et al., 2008).

som tidligere nævnt katalyserer TH omdannelsen af tyrosin til levodopa (L-DOPA), som derefter omdannes til dopamin. Dopamin kan omdannes til noradrenalin og epinephrin. In vitro-eksperimenter har tidligere vist, at TH01 kan regulere TH-gentranskription, der viser en kvantitativ lyddæmpningseffekt (Alban Renos et al., 2001). TH01 alleler hæmmede transkription proportionalt med antallet af gentagelser. I betragtning af at så mange vitale funktioner er afhængige af tilstedeværelsen af dopamin og dets metabolitter (vei et al., 1997; Meiser et al., 2013), har funktionsfejl i dopaminerge veje været forbundet med udviklingen af adskillige psykologiske sygdomme (Meiser et al., 2013), og i denne anmeldelse var TH01 stort set forbundet med schisofreni (Kurumaji et al., 2001) og Parkinsons sygdom (Meiser et al., 2013). Jo længere th01-9.3 og TH01-10 alleler, der forudsiges at give mindre dopamin, blev fundet hyppigere hos individer, der viste træk, der tyder på dopaminerg dysfunktion, såsom impulsiv voldelig adfærd (Yang et al., 2013), seksuelt overgreb (Yang et al., 2010), og afhængighed (Sander et al., 1998; Anney et al., 2004).

nogle modstridende foreninger blev observeret mellem TH01 og visse fænotyper. For eksempel, de Benedictis et al. (1998) rapporterede en betydelig sammenslutning af >9 th01 gentagelser med lang levetid hos mandlige italienske hundredeårige. I modsætning hertil, von vurmb – Schvark et al. (2011) kunne ikke replikere dette resultat, når man brugte det samme undersøgelsesdesign på en tysk befolkning, ligesom Bediaga et al. (2015) var heller ikke i stand til at bekræfte en forening i en nordspansk befolkning. Tilsvarende er der modstridende rapporter om sammenslutningen af TH01-9.3 med SIDS på tværs af europæiske befolkninger. I 2008 Klintschar et al. (2008) fandt, at hyppigheden af TH01-9.3-allelen var signifikant højere hos SIDS-patienter end i kontroller i en tysk befolkning. Denne forening blev yderligere bekræftet af Courts and Madea (2011). Tværtimod, Studer et al. (2014) var ude af stand til at gentage dette resultat i en svensk befolkning. Yderligere befolkningsbaserede associeringsundersøgelser er nødvendige for at bekræfte eksistensen af foreninger mellem TH01 og disse fænotyper.

ingen af undersøgelserne, der undersøgte TH01, har identificeret nogen af de tilknyttede genotyper som årsag til sygdom; derfor bør de nævnte foreninger kun betragtes som mulige eller potentielle. Mange af de træk, der rapporteres at være forbundet med TH01, er multifaktorielle, hvilket betyder, at de påvirkes af både gener og miljø, såsom i tilfælde af Parkinsons sygdom (Meiser et al., 2013) og schisophrenia (Ju et al., 2019).

potentielle foreninger af andre str-markører

Schisofreni er en kompleks arvelig mental sundhedsforstyrrelse præget af vrangforestillinger, hallucinationer og nedsat social kognition. Det er underforstået, at schisofreni er polygenisk med sygdom, der belaster alleler, der fordeles på tværs af flere loci (Giusti-Rodr og Sullivan, 2013; Chuo et al., 2019). I overensstemmelse med denne opfattelse afslørede vores undersøgelse, at schisofreni var forbundet med det største antal STRs: FGA, TH01, VVA, D2S441, D2S1338, D8S1179, D16S539 og D18S51. En undersøgelse (Jacobsen et al., 2006a) fandt, at længere gentagelser i D18S51 og D2S1338 var signifikant hyppigere hos patienter end i kontroller. Denne tendens er i overensstemmelse med udvidelsen af trinukleotid-gentagelser i andre større psykiatriske lidelser. Selvom sygdommens iboende kompleksitet har udgjort en udfordring for forskere, har neurotransmitterabnormiteter længe været anerkendt som en vigtig medvirkende faktor i patogenesen af schisofreni (M., 2005; Modai og Shomron, 2016).

genetiske mutationer alene er ikke nok til at udløse starten og udviklingen af schisofreni; derfor, yderligere forskning er nødvendig for at undersøge, hvordan genetiske risikofaktorer interagerer med miljømæssige risikofaktorer i udviklingen, debut, og progression af tilstanden.

venøs tromboemboli (VTE) er en lidelse defineret ved forekomsten af dyb venetrombose og / eller lungeemboli. VVF er et glycoprotein, der spiller en rolle i blodpladeadhæsion under koagulation; derfor forstås det, at ændringer i serumniveauer af VVF kan bidrage til tromboseforstyrrelser (Laird et al., 2007). Rios et al. (2014) fandt, at VVA-18, TPOPPER-9 og TPOPPER-12 blev observeret hyppigere hos personer med venøs trombose i Mestitsopopulationen. Desuden har VVA og TPOPPER været forbundet med kronisk myeloid leukæmi (Vang et al., 2012).

Trisomys

ned-syndrom eller trisomi-21 kan diagnosticeres ved tilstedeværelsen af en tredje allel ved kromosom 21. Denne trisomi kan være til stede ved enhver polymorf markør, der findes på kromosom 21, og der er flere undersøgelser, der evaluerer brugen af D21S11 og Penta d som effektive markører til påvisning af Nedsyndrom (Yoon et al., 2002; Liou et al., 2004; Shi et al., 2012; Guan et al., 2013). Tilsvarende kan D18S51 og D13S317 bruges som genetiske markører til at diagnosticere tilstedeværelsen af Edvards syndrom (trisomi-18) og Patau syndrom (trisomi-13). Trisomys er et eksempel på en årsagssammenhæng, da alle individer med tre kromosomer vil blive påvirket. Mens tilstedeværelsen af en ekstra allel ved kromosomer 13, 18, eller 21 afslører ikke en medicinsk tilstand, der er ukendt for donoren, det giver yderligere identificerbare oplysninger til efterforskere.

kræft

retsmedicinske STRs er blevet brugt som genetiske markører i flere undersøgelser for at screene for kræftrelaterede alleler. Hui et al. (2014) fandt, at to par alleler (D8S1179-16 med D5S818-13 og D2S1338-23 med D6S1043-11) blev fundet hyppigere hos patienter med gastrisk kræft. Desuden identificerede en undersøgelse fra Kina en signifikant sammenhæng mellem homosygøse alleler ved D6S1043 og en øget risiko for invasiv livmoderhalskræft., 2008). Tab af heterosygositet (LOH) er en genetisk mutation, der resulterer i tab af en kopi af et heterosygøst gen, hvilket ofte resulterer i kræft på grund af tab af funktionelle tumorundertrykkende gener. LOH i forskellige kræftvæv er blevet observeret på en række retsmedicinske loci såsom CSF1PO, FGA, VVA, D3S1358, D5S818, D8S1179, D13S317 og D18S51 hos patienter med laryngeal cancer., 2004). LOH kan ændre resultaterne af en DNA-profil og bør tages i betragtning i tilfælde, hvor kun kræftvæv er tilgængeligt til analyse (Peloso et al., 2003; Jens et al., 2017).

et al. (2018) gennemførte en undersøgelse, der undersøgte muligheden for at bruge genetiske markører snarere end relaterede gener til at screene for disposition for lunge-og levercancer. Denne undersøgelse brugte CODIS markører til at undersøge teorien om programmeret begyndelse, som antager, at forekomsten af en kronisk sygdom er uafhængig af alder og i stedet kan afhænge af et programmeret begyndelsesmønster. Resultaterne viste en signifikant forskel i forekomsten af lungekræft mellem dem, der bar d18s51-20 allelen og dem, der ikke gjorde det, og forekomsten af levercancer mellem dem, der bærer d21s11-30.2 og D6S1043-18 alleler og dem, der ikke gjorde det. Mens disse resultater viser, at CODIS-markører bruges til at forudsige en persons disposition for kræft, er der et omfattende antal kræftrelaterede gener i genomet; derfor er risikoen for at krænke genetisk privatliv med disse oplysninger fortsat lav.

Y og STRs

Y-kromosomet har akkumuleret mandlige fordel-og fertilitetsgener (Lahn og Page, 1997; Graves, 2006), og det er derfor muligt, at fænotyper forbundet med maleness er forbundet med Y STRs. Der er ingen dominerende y-kromosomhomolog), så der kan også være foreninger med STRs. Faktisk har Røntgenbundne gener for nylig vist sig at påvirke mandlig fertilitet og kønsforhold for afkom hos mus (Kruger et al., 2019).

Association Versus årsagssammenhæng

foreningen af en STR med et træk eller en sygdom udleder ikke årsagssammenhæng. Desuden synes nogle alleler at have modsatte virkninger: TH01 allel 9.3 kan hjælpe med stress (Jang et al., 2004), men har også en potentiel forbindelse med selvmord (Persson et al., 1997; Yang et al., 2011). En genetisk variant betragtes som årsagssammenhængende, når det vides, at tilstedeværelsen af varianten vil frembringe en effekt, der igen forårsager sygdom (Hu et al., 2018). Ingen af de foreninger, der er rapporteret i denne undersøgelse, giver bevis for årsagssammenhæng (undtagen trisomys), snarere foreslår de et generelt forhold mellem nogle STRs, der anvendes i retsmedicinske applikationer og en fænotype. Disse forhold kan også forklares ved forvirrende variabler, bias eller tilfældigt i tilfælde, hvor et signifikant fund ikke kan replikeres af en anden undersøgelse. Faktisk kunne denne gennemgang ses som en afspejling af den bredere såkaldte “replikationskrise” inden for videnskab (Schooler, 2014). Mange af de undersøgelser, der er rapporteret i denne gennemgang, er muligvis ikke tilstrækkeligt afbødet mod “multiple sammenligningsproblemet”, hvor en række sammenligninger vil være betydelige ved en tilfældighed. Ved at sætte vores p-værdi tærskel til 0,05, risikerer vi, at 5% af de betydelige resultater er betydelige ved en tilfældighed.

mange af de træk, der kan forudsiges ved genetisk analyse, er resultatet af epistatiske interaktioner mellem gener og miljøfaktorer. Når man overvejer foreningerne i denne gennemgang, det er ikke rimeligt at antyde, at et individ, der besidder den hyppigere observerede allel, der er forbundet med et træk, vil udtrykke en specifik fænotype. Der er mange underliggende mekanismer involveret i udviklingen af komplekse sygdomme, og mens risikoen for, at retsmedicinske STRs viser sig at afsløre afslørende medicinsk information, er minimal, tilstedeværelsen af en bestemt allel kan indikere øget potentiale eller risiko for en fænotype.

molekylære mekanismer

selvom det stadig er sandt, at retsmedicinske markører er placeret inden for ikke-kodende regioner, er der voksende bevis for, at STRs i introner og op – eller nedstrøms af gener kan påvirke fænotype. STR-mutationer i den 5 ‘ uoversatte region (UTR) er kendt for at modificere genekspression, sandsynligvis fordi de tjener som proteinbindingssteder (Li et al., 2004). Mutationer i 3 ‘ UTR resulterer i udvidet mRNA, som kan være giftigt for cellen (Li et al., 2004; La Spada og Taylor, 2010). Der er 13 CODIS STRs placeret i introns (supplerende tabel 2). Mutationer i introner kan påvirke mRNA-splejsning, hvilket kan resultere i genhæmning eller tab af funktion (Li et al., 2004; La Spada og Taylor, 2010). TCAT-gentagelsen i den første intron af TH01 fungerer som et transkriptionsregulerende element in vitro (Meloni et al., 1998). Alban Larsen et al. (2001) rapporterede en reduktion i transkriptionsaktivitet af TH, da TCAT-gentagelsestallet varierede fra tre til otte. STRs findes også ved høj densitet i promotorregioner, og det er meget sandsynligt, at nogle er impliceret i genekspression ved at modulere afstand mellem regulatoriske elementer (Gemayel et al., 2012; Et al., 2013; Gymrek et al., 2016; Pernille et al., 2016; Gymrek, 2017).

der er nu etiologisk støtte til STRs som årsagsmidler til sygdom, idet de er ganske plausibelt epigenetiske regulatorer til genekspression, når de er placeret i introner eller op – eller nedstrøms af gener. Dette kan øge forudgående støtte til hypoteserne om tilknytning og dermed reducere det krævede signifikansniveau, som beskrevet af Kidd (1993), hvilket er en modsætning til det “multiple sammenligningsproblem”, der blev diskuteret tidligere.

konklusion

mens resultaterne af denne undersøgelse indikerede et stort antal fænotypiske træk forbundet med retsmedicinsk STRs, blev ingen fundet at være uafhængigt årsagssammenhængende eller forudsigende for sygdom. Ikke desto mindre, da der er adskillige rapporterede tilfælde af tetranukleotid-gentagelser, der er impliceret i sygdom, og molekylære mekanismer er blevet påvist, er der stadig en stærk chance for, at denne slutning kan ændre sig i den nærmeste fremtid. En begrænsning af denne undersøgelse var den eneste anvendelse af UCSC-genomsøgeren. Fremtidige undersøgelser kan drage fordel af at bruge en bredere vifte af ressourcer og undersøge yderligere markører såsom SNP ‘ er i flankerende regioner, mtDNA og Y-STRs. I tilfælde af at der opdages en statistisk signifikant sammenhæng, årsagssammenhæng eller forudsigelig sammenhæng, er det ikke nødvendigvis en gyldig årsag til fjernelse fra STR-paneler, men yderligere beskyttelsesforanstaltninger, såsom stramning af lovgivningen omkring genetisk privatliv, kan muligvis overvejes for at forhindre misbrug af disse oplysninger.

Forfatterbidrag

NV designede studiet, udførte litteraturgennemgangen og skrev manuskriptet. MB udtænkte projektet, designede studiet og gennemgik og redigerede manuskriptet. DM udtænkte og ledede projektet, designede studiet og gennemgik og redigerede manuskriptet. Alle forfattere bidrog til artiklen og godkendte den indsendte version.

interessekonflikt

forfatterne erklærer, at forskningen blev udført i mangel af kommercielle eller økonomiske forhold, der kunne fortolkes som en potentiel interessekonflikt.

supplerende materiale

det supplerende materiale til denne artikel kan findes online på: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00884/full#supplementary-material